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问题 植物线粒体组装unicycler软件里的spades报错

...      (kmer_coverage_model.cpp   : 218)   Too many erroneous kmers, the estimates might be unreliable  * 0:07:10.518  1785M / 18G   WARN    General                 (kmer_coverage_model.cpp   : 327)   Valley value was estimated improperly, reset to 3  * 0:07:10.523  1785...

文章 vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题

...pyright (C) 2023 Free Software Foundation, Inc. This is free software; see the source for copying conditions. There is NO warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. Written by Roland McGrath and Ulrich Drepper. 版本够,如果不够你就下载一下新版的然...

问题 请问为什么GWAS用tassel mlm模型画的manhattan图什么都没有呢 也没有报错 能生成一个什么都没有的图片 只有坐标和题

...nicle_manhattan -c 1.3e-6 --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: www.omicsclass.com --> Recommended to learn R language: --> https://study.163.com/course/introduction/1209073807.htm?share=1&shareId=1030291076 Loading required package: ggplot2 input chromosome nam...

文章 textshaping L :1:19: fatal error: hb-ft.h: No such file or directory

...-- [ANTICONF] --------------------------------Configuration failed to find the harfbuzz freetype2 fribidi library. Try installing: * deb: libharfbuzz-dev libfribidi-dev (Debian, Ubuntu, etc) * rpm: harfbuzz-devel fribidi-devel (Fedora, EPEL) * csw: libharfbuzz_dev libfribidi_dev (Solaris) * brew...

文章 ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

...t(1 - fm), method = finalLinkage) # # Cluster method : average # Number of objects: 128 results[[2]][["consensusClass"]][1:5] # 01005 01010 03002 04006 04007 # 1 1 1 1 1 计算聚类一致性 (cluster-consensus) 和样品一致性 (item-consensus) icl <- ca...

文章 小麦MADS-box基因家族文章 new phytologist（7分）

...-box基因家族成员在拟南芥和水稻中的成员数量分别是43和45个，拟南芥和水稻的基因组大小相差很大但是家族成员数量相差不大，说明MADS-box家族成员数量还是很保守的。而在小麦中却有201个，在开花类植物中是最多的。作者推...

问题 python rpy2 报错

...thon3/lib/python3.8/site-packages/rpy2/rinterface_lib/conversion.py", line 45, in _    cdata = function(*args, **kwargs)  File "/share/work/biosoft/python/Python3/lib/python3.8/site-packages/rpy2/rinterface.py", line 810, in __call__    raise embedded.RRuntimeError(_rinterface._geterrmessage())...

文章 deepseek绘图之--微生物堆叠柱状图

...cks = element_line(color = "black"), axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1), legend.position = "right" ) + scale_y_continuous(expand = c(0, 0)) # 确保柱子贴住x轴 更多生信课程：

问题 单倍型报错

...fix = hapPrefix,  # 单倍型名称前缀             angle = 45,             # 物理位置的角度             displayIndelSize = 0,   # 图中展示最大的Indel大小             title = "HapTable")         # 图片标题dev.off()####...

文章 biolinux虚拟机不能为虚拟机打开一个新任务，或者一直黑屏解决办法

...拟电脑 Bio-Linux-8.0.7 打开一个新任务.VT-x is disabled in the BIOS for all CPU modes (VERR_VMX_MSR_ALL_VMX_DISABLED).返回 代码: E_FAIL (0x80004005)组件: ConsoleWrap界面: IConsole {872da645-4a9b-1727-bee2-5585105b9eed} 报错截图： 解决办法： 当...

文章 饼图pie-ggplot2

...-34/2 归纳为cumsum(dat$Num)-dat$Num/2 cumsum(dat$Num)-dat$Num/2[1]  45.0 107.0 152.0 229.5 286.5 而且图例也是反向的，需要结合guides(fill=guide_legend(reverse=T)) 并且希望第一个颜色对应最后一个因子“A"，scale_fill_brewer(palette ="Set3",direction = -1) ...

文章 At core/community/optimal_modularity.c:87 : GLPK is not available, Unimplemented function call

...o microscopic_update.o mixing.o motifs.o operators.o optimal_modularity.o other.o paths.o plfit/error.o plfit/gss.o plfit/kolmogorov.o plfit/lbfgs.o plfit/options.o plfit/plfit.o plfit/zeta.o pottsmodel_2.o progress.o prpack.o prpack/prpack_base_graph.o prpack/prpack_igraph_graph.o prpack/prpack_pre...

文章 挖掘公共基因大数据的时代已经到来

...数据的挖掘典范，当属TCGA数据库。 TCGA一A座金矿 TCGA（The Cancer Genome Atlas ）数据库，目前收录了33种癌症，11000多列病人的多个组学的数据以及临床表型信息。组学数据包括基因组的变异，转录组，miRNA, 甲基化，蛋白质组等。...

文章 快速解读：3-5分的蛋白质组学文章思路

...验验证，注释是精确的； TrEMBL：数据库全称“Translation of EMBL”，是从EMBL中的cDNA序列翻译得到的，其中TrEMBL收录的是未经人工注释的编码DNA序列翻译数据； KEGG：翻译成中文是京都基因与基因组百科全书，是一个整合了基因组...

文章 快速解读：3-5分的蛋白质组学文章思路

...验验证，注释是精确的； TrEMBL：数据库全称“Translation of EMBL”，是从EMBL中的cDNA序列翻译得到的，其中TrEMBL收录的是未经人工注释的编码DNA序列翻译数据； KEGG：翻译成中文是京都基因与基因组百科全书，是一个整合了基因组...