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话题 metadata格式

话题 数据格式问题

文章 plink 软件core dumped报错

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 cBioportal使用教程

...的可视化总结。 整合进cBioPortal的基因组数据类型包括体细胞突变,DNA copy-number alterations(CNAs),Mrna和microRNA(miRNA)表达,DNA甲基化,蛋白质富集,磷酸化蛋白富集。目前,网站包含从多个癌症研究的数据集。网站的简化概念是...

文章 已知目标基因,如何进行局部共线性绘图?

...三个文件: 1.各物种的基因组序列文件(即cds序列,fasta格式) 2.记录各物种基因位置信息的基因组注释文件(gff文件) 3.绘图布局文件(layout文件) 前两种文件的格式想必大家已经很熟悉了,在这里我们不再做赘述,那么,layout文...

文章 泛基因组视频课程介绍

...tps://rrwick.github.io/Bandage/, 图形可视化软件,支持输入GFA格式的文件可视化,在基因组组装中用的比较多,但是也可以展示泛基因组的结果; odgi:https://github.com/pangenome/odgi,是一个专门用于可视化泛基因组的工具,是一个命令...

问题 gff文件基因名重命名

老师您好,我想把我的gff文件中的文件名修改成下图格式怎么操作?"物种简称_染色体号_000001" gene为G,其他为T

问题 泛基因家族分析

...t文件对应哪一个文件?是last.gene.pair文件,但是我看内容格式都不大一样。

问题 老师,您好!我用PLANTCARE 分析完了启动子,想把顺式作用软件画在基因启动子上,用啥软件好?

问题 我做群体结构研究

没当到了绘图步骤的时候,就会报错,保存原因是:pi_manhattan_plot.rcommand not found…我做了不同的分析,发现只要调用.r结尾的软件,绘图之类的就会报错,怎么解决

文章 2019年国自然结果分析,生命科学领域难度又又又增加了吗?

...经常有很多朋友问学霸姐姐:**学校的生物专业/医学专业怎么样啊? 你对照看看以上这两个表,大概就知道了吧。 今年的难度比往年大吗?——是的! 曾几何时有两三篇 3-5 分的 SCI,甚至不一定是专业领域的核心期刊,都可...

文章 基因家族鉴定分析操作手册:

...快。   提取顺势作用原件,利用GSDS绘图: 9.基因亚细胞定位 蛋白亚细胞定位笔记: https://www.omicsclass.com/article/1438  10 蛋白三维结构分析 参考笔记: https://www.omicsclass.com/article/1441  11.基因家族加倍与扩张 基因家...

文章 在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

...l -c conda-forge pcre 确保你的系统和R都有足够的权限来安装软件包,并且在安装或更新库后重新尝试运行R。

文章 电脑双显示器如何配置?

...的个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决:1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操 2. 2区文章...

文章 最新2区SCI思路解析—杨树TPS/TPP基因家族的系统分析

...成员的理化性质,包括CDS长度、等电点、平均亲水性、亚细胞定位预测等,详见上图Table1/2。3. 杨树中PtTPS和PtTPP家族成员蛋白保守结构域分析作者分析了PtTPS和PtTPP两家族各自成员间Motif保守序列的差异。 4. 杨树中PtTPS和PtTPP...