2个组织部分，在不同处理下，具有4次生物学重复的组学分析。 利用什么分析方法，可以在一张图中得到：不同处理，这两部分组织的之间的关系（聚类）
在作GSEA的分析时候需要提供一个预先定义好的基因集，用来评估基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的影响作用，那么基因集都包括哪些呢？ GSEA官网的基因集Molecular Signatures Database，含...
...的，目前世界上最恐怖的病毒、霉菌、细菌等等，都在这个实验室里， 这个实验室被层层保护， 是一个与世隔绝的、密封的生态体系， 你得穿着像“宇航服”一样的防护服才能进去。 图：美国陆军传染病医学研究所的实验...
A =c("abcdgegh")B = c("abcdgegh","deghgabcd") 匹配 grep(pattern, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, value = FALSE, fixed = FALSE, useBytes = FALSE, invert = FALSE)grepl(pattern, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE, useBytes = FALSE)##ignore.case 决定匹配是否对...
...来，基因组测序爆炸性增长，比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢？比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之间的基因和基因家族的比较分...
bedtools intersect -wo -nonamecheck -F 0.1 -a region_merged.bed -b $vcf >var.txt ***** ERROR: -b option given, but no database file specified. *****
...者弄清项目的剩余时间，评估工作进度，调整工作任务，更好地把握项目的整体。 2.2 站立会、周会 每日站立会以及周会是保证项目正常进行的手段之一，通过每天的站立会沟通，确认团队成员是否遇到了问题，针对问题进...
分别生成的五个表格，合并成一个。横标一样，竖标不同。
基因家族分析，既是一个可以快速掌握的生物信息分析技能，也是低成本SCI文章思路。基因家族文章写作模式相似，换个物种或者基因家族就又是一篇文章，可借鉴性很强，且发文数量依然不减，是低成本短、平、快SCI文章的经...
...的好材料。 2. 设置取样时间点较多，贯穿实验全程，可更好观察春化过程中基因表达的动态变化；另外，较多时间点非常适合WGCNA分析，这也是本文亮点之一。 3. 关注性状相关通路及基因梳理较为清晰，并根据转录组数据提...
...人也扛不住： 图片来源见水印 而最近，有一个好消息来了！ 人大常委会委员建议：取消本科生、研究生发表论文的规定。 24日，全国人大常委会委员蔡昉建议，“纠正大学发展中一个错误导向，取消对研究生甚至...
请问 功能结构域都有具体序列吗 比如pfam其实就是个模型 没有具体序列吧 WRKY众所周知的功能结构域序列WRKYGQK 但其他所有基因功能结构域序列都可以找到吗
...微环境，肿瘤细胞产生了代谢异质性，这已成为癌症的一个重要特征。相对于正常细胞肿瘤细胞最常见的代谢改变之一是有氧糖酵解，也称为Warburg 效应。Warburg 效应是几乎所有癌细胞的代谢特征：正常分化的细胞主要依靠线粒...
之前的笔记分享过安装R包的三种方法 https://www.omicsclass.com/article/1970 以下是关于R及R包的更新、卸载和删除 一、更新R version #查看现有R版本install.packages("installr")library("installr")updateR() #安装并加载installr包，并调用里...