问题 老师，请问为什么我的evolview颜色设置和设置基因名称不匹配？

问题 docker怎么设置镜像以及内存，最后一张图是基因家族分析课程里面介绍的，但是docker v24.0.5版本中docker engine的界面完全不一样；然后请问memory内存如何能扩大呢

文章 GEO 数据介绍及在线下载

...类型有那些呢？ GEO数据库里的数据是免费的，可以直接在线下载。但是，在下载数据之前你要了解GEO数据库的4个概念和4个数据存放类型： GSE数据编号(Series)GPL数据编号(GEO platforms)GSM数据编号(Samples)GDS数据编号(Datasets) 一篇文...

问题 如果虚拟机运行不了共线性分析，老师们建议在win系统上下载mcscanx软件包自己尝试吗？

问题 经旋转调整后evolview进化树依然出现分支节点跟mega11不匹配的问题

问题 老师您好，heatmap在线网站画热图，为啥不显示基因名称呀？

文章 BLINK（C版本） 进行 GWAS分析的教程

... 期: 高速高效全基因组关联分析软件 BLINK | 华人基因组学在线沙龙 (cgmonline.co)

文章 trinity的下载与安装

...规模的RNA-seq的reads数据。 trinity的下载与安装 trinity最新版本是v2.8.5 下载官网在：https://github.com/trinityrnaseq/trinityrnaseq/wiki 解压：tar -zxvf Trinity-v2.8.5.tar.gz cd trinityrnaseq-Trinity-v2.8.5 编译：make注意：trinity需要3.1以上版本的CMake ，记...

文章 推荐一款好用的基因结构图在线绘制工具！

...击链接查看吧！今天我再为大家介绍一个绘制基因结构的在线小工具：Exon-Intron Graphic Maker。它可以根据序列长度等比例绘制基因的结构元件，如5' UTR、CDS、外显子、内含子、突变位点、结构域、3' UTR等。下面，我们一起来了解...

文章 手把手教你在线分析转录因子结合调控分析（植物）

今天介绍一个植物的转录因子调控的综合性分析网站PlantRegMap，该网站的功能非常的强大，其主要功能包括如下： 1. 植物转录因子预测     输入蛋白序列或者核酸序列即可对是否是转录因子进行预测，如果是转录因子，会对...

问题 基因组立调出来序列与NCBI上下载序列有差别

最近在做基因家族分析时发现，起初使用虚拟机进行筛选的，而后使用自己的转录组数据分析，相比之前多了几个基因，也就加进去了，使用虚拟机进一步分析了，在后期进行理化性质分析时发现虚拟机从基因组里调出来的蛋白...

问题 你好老师，我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，老是报错。谢谢回答

老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的...

文章 正则表达式

...的简单编程语言。通过“模式”将“字符串”分为两组（匹配/不匹配）。 1. 简单模式（//），匹配简单的直接量字符串。      $_="yabba dabba doo";     if(/abba/){        print "It matched!\n";  #返回匹配为真} 2. 元字符，在正则...

问题 老师您好，xena里下载的经过log（counts+1）的值可以直接用DESeq2包进行差异分析吗，还是需要再转换回去？

问题 binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢