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问题 想问一下大家做蛋白质谱搜库分析的时候用maxquant我原始文件是wife.scan格式的不是raw格式的用此软件可以吗,因为看到在选项里面是有wiff的,但是我发现最后性能那里不能得到结果显示报错,想问有没有大神可以解答一下呀多谢多谢

问题 如何手动将aln转成axt?

kaks计算用了很多种方法转换axt,最后计算都说不equal,查看序列都相同,也符合三的倍数,都含有ATG,但是就是不equal,查到老师说可以用notepad++手动转成axt,请问怎么转呢?

文章 项目管理实践|项目管理到底该怎么做?

...不管这个资源是否工作太多,或反之亦然。CORNERSTONE统计视图都可帮助项⽬经理全⾯掌握项⽬进度和团队表现,了解每位成员⼯作产出与⼯时,提前化解潜在⻛险。 3. 任务关联 大家是否曾从事过一个完全独立的开发项目?我...

问题 请问用TBtools在进行 进化树+基因结构+motif—1张图全显示的时候,只做motif和进化树的组合可以显示,加上基因结构的gff文件就不行了,认为是基因ID不一样导致的。请问gff文件应该是什么样子的啊

这个是三个提交之后的结果 下图是我的gff文件 下图是我试着把ID后面的部分信息删掉之后的gff文件 这样之后还是出不来结果。求指教

问题 老师,我用mcscanX分析出Segmental之后,计算KAKS

老师,我用mcscanX分析出Segmental之后,计算KAKS,然后很久才出结果,大概十五分钟,结果如下为什么KAKS显示NA, 没有值呢,并且用来计算KAKS也是出现如第二幅图所示的结果,(kaks显示NA) 的情况,这是什么原因造成的?

文章 R markdwon 代码块选项说明:

...ns) 节展示了更多例子。 eval: 是否运行该代码块echo: 是否显示代码块内容results:如何处理代码块和运行结果        'hide': 隐藏代码块的运行结果。results = 'hide' 加上 echo = FALSE 等价于 include = FALSE        'asis': 将运行...

文章 linux查看文件夹大小

...最后一次更新的时间上下排列,并会以KB、MB等单位进行显示更加直观地显示文件大小,默认的单位是B。 du :查看当前目录和子目录文件夹/文件大小情况 du [OPTION]… [FILE]…-c, --total 累计大小 -d, --max-depth=N 决定统计每个目录...

文章 blast比对软件使用

...,匹配列表最多显示多少个subject,默认值为500 -m:设定搜索结果显示格式,m参数的选项有12个(通常用-m8格式) -o:输出文件的路径 -p : 可选择blast的方法:blastp,blastx,blastn -pquerydatabaseblastn核酸核酸blastp蛋白质 蛋白质blastx...

文章 circos-基因组圈图绘制软件基础绘图

...一是染色体信息文件(核型文件),主要目的是在图片上显示出染色体,并进行颜色等相关设置;其二是标签文字文件(文本text文件),主要目的是在染色体上具体的位置将基因作为label显示。 核型文件(chr.info)格式如下所...

文章 blast在linux上的用法

...小结果越可靠 -o:查询结果输出文件名 -m:比对结果显示格式选项,缺省值为0,即pairwise格式。另外还可以根据不同的需要选择1~6等不同的格式。 I:在描述行中显示gi号I/F,缺省值F -v:单行描述 (one-line description) 的...

文章 植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

...你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做到——Mapman! (官方网址:https://mapman.gabipd.org/)。 Mapman是一个针对植物,对基因在生物体代谢途径和生物过程中的功能进行...

文章 OTU互作网络分析用MENA

...,包括文件大小,格式等等(下图)。提交成功后会自动显示上传数据的大致信息,包括样本数量、OTU数量等等。 提交成功后会自动显示上传数据的大致信息,包括样本数量、OTU数量等等。 构建网络 点击左侧Construct the network...

文章 Mapchart绘制基因染色体位置图时加标尺

绘制图片时可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置,方法如下: 选择tools -> chart options , 在 Loci 中选择 Ruler at page margin。 结果如下: 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可...

问题 超大的文本文件如fasta,fastq文件在windows中如何打开

1.7G的fa文件用什么工具可以打开,editplus和notepad++都打不开。

问题 MCScanX运行无结果

...两个菌的gff文件简化并合并在一起的结果: 然后运行显示如下: 无结果啊啊啊啊!!!这是为啥,看了大家之前的提问,我对比了文件也没啥问题,而且这两株菌有很高的相似性,不可能没有共线性结果,还请大家帮我看...