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文章 用Perl一次性读入文件全部内容

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

文章 GSEA分析需要的基因集Molecular Signatures Database是什么?

...免疫相关基因集合。 在GSEA的分析时,可以链接网络使用在线的这些基因集,或者把这些基因集下到本地使用。

文章 VBox虚拟机鼠标如何在物理机与虚拟机间切换

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文章 性价比超高5个重测序发IF=6遗传进化文章

...出预算;今天看到一篇文章,可大大降低做群体遗传进化分析的成本;那就是做混池测序; 拟南芥混池测序遗传进化 作者在意大利北部的阿尔卑斯山脉同海拔区域选取19-29 个体进行混池高深度测序(平均测序深度19-50X)...

问题 基因加倍与串联重复分析

老师,在进行基因加倍与串联重复分析时,输入该命令:blastall -i pep.fa -d pep.fa -e 1e-10  -p blastp  -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast,运行结束后,MCScanX出现如下问题: 打开pep.fa查看序列为: 在AT.blast文件中没有查找到K5AEM0的结果,...

文章 IT项目管理经验分享, 如何做好IT项目管理

...天聊一些实战经验,略偏重 IT 开发项目,也是我们基于在线和远程办公的一点思考。 远程办公改变了组织和团队的形式,因此对项目管理的能力要求也大大提高了。 1. 同时管理多个项目的能力 像多核CPU 一样,同时开...

文章 R语言中读入数据时指定每一列数据类型

...从而导致第一列变为 "1" ,而非 "01"。这可能会导致后续分析出现问题。 为避免出现这种情况,需要为其指定数据类型,用到参数为colClasses ,colClasses参数使用一个向量,为每一列指定数据类型。如下所示: data <- read.table(f...

文章 2022年基因家族第1篇—大型动物基因家族分析怎么写?!

基因家族分析植物中非常常见,动物多见鱼类等海洋动物,牛羊等大型动物的基因家族分析文章比较少,那么大型动物能能整理基因家族分析类文章呢?答案是肯定的,今天,我就给大家介绍一篇2022年1月11日见刊的介绍牛中Wn...

文章 2018年测序相关国自然基金最全统计

...RNA的研究。 当然现在关于RNA方面更多的是多种RNA的联合分析,如ceRNA。 另外,其他类型测序相关的课题数目在17和18两年内的变化大,尤其以蛋白质组学为研究方向的课题依然多,这也说明很多老师还没有开始从事蛋白方...

文章 修改单细胞转录组分组

...# 加到 obj_all@meta.data 里# 合并成一个新列 TE_subtype# 其他没匹配到的细胞,保持原来的 celltype# 先初始化 TE_subtype 为 celltypeobj_all@meta.data$TE_subtype <- as.character(obj_all@meta.data$celltype)# 找到 T 细胞中能在 obj_all 里匹配到的行名t_cells <...

文章 使用hisat2软件将测序数据比对到基因组

...ort -o rnaseq.bam rnaseq.sam 有比对的bam文件,就可以进行后续分析了。 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:...

问题 拟时序分析分化方向和实际相符合

老师,在做拟时序分析的时候,做出来细胞分化轨迹的结果和实际细胞分化方向有差异,可以怎么调整参数得到和生物学上分化方向相同的结果呢?

问题 在执行命令的时候,遇到软件需要更新版本,怎么处理,

文章 群体遗传进化与GWAS分析镜像更新2.0

...:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像, 这个已经更新到百度云盘中,大家重新下脚本资料即可 视课程:https://bdtcd.xet.tech/s/3QzQFb

文章 Samtools截取基因组序列(Docker篇)

...Docker工具下安装请参考:Docker 工具安装(windows Toolbox版本)详解版!和 Docker 工具安装(windows 桌面版)详解版!,这里便多介绍了。 下镜像并运行 安装好Docker后,搜索我们omicsclass提供的docker镜像,其中便有安装好samto...