利用GSEA分析之后，出现的结果里面突然不明白，Table: GSEA details 里面应该是包含这个GO set的所以基因的意思，后面yes表示上传数据有这个基因 那个core enrichment含义是什么。。。。
...不均匀，出现了一条超级染色体，如下图：希望帮忙看看分析代码问题（附件：1组装流程简化.sh），下文为简单的分析流程总结。
mcscanX分析时用的是蛋白比对，在筛选基因家族串联重复基因对的时候未筛到，用了课程里的筛选方法，发现用的是CDS比对，我想问下哪个更准确？？？筛选结果不一样~
...Docker工具下载安装请参考：Docker 工具安装（windows Toolbox版本）详解版！和 Docker 工具安装（windows 桌面版）详解版！，这里便不多介绍了。 下载镜像并运行 安装好Docker后，搜索我们omicsclass提供的docker镜像，其中便有安装好samto...
请问一下mcscan分析时，蛋白序列per.fa文件里是3w多基因，计算后图中标识这里是9W多，不知道什么原因啊？基因组怎么会有9万多基因呢？
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
不知道为啥今天早上起来之后就一直在报错了，文件夹也是存在的，很迷惑
...何？中，跟大家介绍了GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）及其分析结果。GSEA是一种基于基因集的富集分析方法，在对基因表达数据分析时，首先确定分析的目的，即选择MSigDB中的一个或多个功能基因集进行分析，然后基于基因表达数...
...比对，用featureCounts进行定量，得到结果文件上R进行差异分析，得到1300多个差异基因，gene_id转换时，差异基因从1300多到最后才900多（提取的Sus_scrofa.Sscrofa11.1.115.gtf和org.Ss.eg.db_3.22.0.tar.gz的entrez id和symbol合并到差异差异基因列表...
小麦TCP基因家族分析原文献下载（点此链接）：Genome-Wide Identification and Expression Profiling of the TCP Family Genes in Spike and Grain Development of Wheat (Triticum aestivum L.).pdf 小麦TCP基因家族分析文献解读 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图...
安装的时候，一切都很顺利，然后MCScanX对at的共线性分析也很顺利，但是在下游分析family_circle_plotter，报错了。再次回到MCScanX下去make的时候，不成功，报错为：Nothing to be done for 'default'.
...，用我的继续下一步# 保留相似度100以及基因之间的最佳匹配 python3 $script/find_1vs1_v2.py last.txt 1vs1.txt结果显示错误：Traceback (most recent call last): File "/work/script/find_1vs1_v2.py", line 36, in <module> find_max_third_column(args.input_file, arg...