...准备好之后可以导入网络了，方法： 设置网络的，节点信息： 然后就可以得到网络图了: 2.2 网络图修改美化 上面的网络图比较丑，可以做一些修改美化，比如，点的型状颜色，线的颜色等等设置； 整体设置： 更多...
...RNA是没问题的，都能正常与老师提供的对应上 对于mRNA的信息有点出入，不知道如何择选的，因为genecode上面没有单独mRNA这个数据包 也根据视频下载的是核染色体的基因注释，这就使得非编码和编码的都包含了，这个从我打开...
报错信息：Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException at family_circle_plotter.paint(family_circle_plotter.java:197) at family_circle_plotter.main(family_circle_plotter.java:334) 有看到相同的问题，于是检查了自己文件内容格式及路径 AT.gff 以及 AT...
...自圆其说，发一篇三四分的文章还是很简单的；更多具体信息请下载原文观看吧！ 同样做转录组实验，为什么有人可以发二区文章，而有些人却发不出去呢？究其原因无非是以下两个原因： 转录组数据结果似懂非懂，无法做...
补问：在用官网的biolinux系统做motife分析的时候，输入meme软件的时候，显示没有这个软件，请问怎么安装？ 初涉生物信息，不胜感激
... 'NA/pathway2name.tsv': No such file or directory Execution halted 报错信息提示：找到不到那个表格，请问老师这是哪里出现了问题？这个输入的代码：Rscript $scriptdir/eggNOG/eggnog_stat.r -o Plu.eggnog --emapper_anno .emapper.annotations -f Plu.gene.pep.fasta --k...
...惠等你来拿！截止到今天，组学大讲堂共计发布30+门生物信息视频教程，涵盖数据结果解读、转录调控、基因家族、癌症数据库挖掘、微生物研究、编程语言（Python、R、Perl）等方向，学员数量22000+！多门课程被推送到网易首页...
...会包含额外的多个边。assembly_info.txt #contig的额外的信息 每个contig就是图里一个唯一的边，同时这个唯一的contig也会进行两边延伸，来解决repeat区域。 因此，具有相同id的contig，会比相应的edge要长。这个同OLC算法的软件...
...E178341数据下载与预处理代码：这个数据是h5格式的，样本信息分开的，需要合并一下：#数据下载 wget -c "https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE178nnn/GSE178341/suppl/GSE178341%5Fcrc10x%5Ffull%5Fc295v4%5Fsubmit.h5" -O GSE178341_crc10x_full_c295v4_submit.h5 wget -...
...图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...
...NPs、插入缺失、倒位、易位等变异；复制区域和重复序列信息；基因组共线性区块 3. plotsr 绘图： # 整理绘图config文件 echo -e "##ft = File type (fa:fasta/cl:chromosome_length, default = fa. cl files are fasters)##lc = line colour##lw = line width##f...
...t;file>... #修改最后一次提交。用于修改上一次的提交信息，或漏提交文件等情况。 git commit --amend #回退所有内容到上一个版本 git reset HEAD^ #回退a.py这个文件的版本到上一个版本 git reset HEAD^ a.py #向前回退到第3...
盐芥的基因组有新的到染色体水平的数据，但是没有基因的GFF3数据。如何获得或自己制备基因的GFF3文件，用于对基因家族的生物信息学分析？
...$project_id，获取TCGA中最新的不同癌种的项目号，更新项目信息对应癌症名称：https://www.omicsclass.com/article/1061 > getGDCprojects()$project_id [1] "TCGA-MESO" "TCGA-READ" "TCGA-SARC" [4] "TCGA-ACC" ...
...录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...