找到约 15 条结果

文章 IF=3.47|非肿瘤-眼部老年黄斑变性ceRNA文章思路

...ed macular degeneration: From construction to identification. Exp Eye Res. 2021 Feb;203:108427. doi: 10.1016/j.exer.2020.108427. Epub 2020 Dec 29. PMID: 33383027. 延伸阅读 GEO数据库挖掘—WGCNA鉴定骨肉瘤转移相关基因GEO、TCGA多数据库联合挖掘胰腺导管腺癌预后关...

文章 FGF21突变让你吃多甜食也不发胖？

...糖和酒精摄入的激素。 Frayling等人研究了UK Biobank里约45万人的健康信息（包含血样指标、饮食偏好调查等信息），经过统计发现具有特定FGF21基因突变（rs838133）的人在生活中摄入了更多的糖类、酒精，而在脂肪、蛋白质等营...

问题 运行DESeq2出错

各位老师，可以帮我看一下吗 Error in h(simpleError(msg, call)) :   error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'rowSums': could not find function "cpm"Calls: std_two_condition_comp_deseq2 -> new_DGE_list -> rowSums -> .handleSimpleError -> h

文章 错误：perl: warning: Please check that your locale settings: LANGUAGE = (unset), LC_ALL = (unset), LC_CTYPE = "UTF-8", LANG = "en_US.UTF-8"

...ashrc 或 ~/.bash_profile 文件加上下面的参数， # Setting for the new UTF-8 terminal support in Lion export LC_CTYPE=en_US.UTF-8 export LC_ALL=en_US.UTF-8 如果是使用zsh的mac，则是修改~/.zshrc文件 # Setting for the new UTF-8 terminal support in Lion LC_CTYPE=en_US.UTF-8...

问题 用gffread将gtf转化为fasta报错

命令行： gffread -w classcode.fa -g Genome.fa classcode.gtf 报错：Error: sequence lines in a FASTA record must have the same length! 输入的参考基因组：

问题 我的Conda 根本安装不成功软件，比如UMI tools ，怎么办

... DistributionNotFound(req, requirers) pkg_resources.DistributionNotFound: The 'umi-tools==0.2.3' distribution was not found and is required by the application

文章 EggNOG基因序列批量注释

EggNOG (Evolutionary Genealogy of Genes: Non-supervised Orthologous Groups)是基于直系同源蛋白进行分组比对的一个公共资源数据库，由EMBL维护，提供了不同分类水平蛋白的直系同源分组（Orthologous Groups ，OG），包括真核物种、原核物种及病毒...

文章 clusterProfiler非模式物种 KEGG与GO富集分析

...释结果，直接使用就可以，比如人里面可以直接用clusterProfiler进行基因集的富集分析；但是，对于非模式动物与植物的研究对象往往没有现成的注释结果，就没法直接进行富集分析； 因此学会基因功能批量注释非常重要；这里...

文章 Python学习-利用Python对植物基因组注释文件（gff3格式）进行处理

...])+'\n') input_file.close() # make by ligaojie from North China University of Technology（华北理工大学生命科学学院生物信息学）

文章 UpSetR包绘制多维的venn图

...ist('A','B','C'), color = "orange", active = T))) ### sort by frequency of intersection upset(fromList(dataForUpSetPlot), nsets=length(dataForUpSetPlot), nintersects = 1000, sets = c("A", "B", "C", 'D'), #keep.order = TRUE, point.size = 3, line.size = 1, ...

文章 GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

...上图内容。 差异分析 点击分析页面左下角Compare 2 sets of samples，第一步，选择检验方法和阈值（见下图A）；第二步，选择差异对比组，点击Select which Samples to put in Group A and Group B，出现样品处理信息，据此设定A组样品和B组样...

问题 使用悟空云平台进行代谢组数据矫正时报错

其余五种归一化方式均正常，只有QC-RLSC报错显示error in evaluating the argument X in selecting a method for function "t: NA NaNI nf in foreign function call (arg 5)

问题 gatk4 HaplotypeCaller报错

...R has occurred: Bad input: We encountered a non-standard non-IUPAC base in the provided input sequence: '13' 请问这个怎么解决呢？

问题 成功安装WGCNA包后，调用时报错

....30.4), R 3.5.2 (2018-12-20) Installing package(s) 'WGCNA' also installing the dependency ‘GO.db’trying URL 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.5/WGCNA_1.66.zip' Content type 'application/zip' length 3436551 bytes (3.3 MB) downloaded 3.3 MBpackage ‘WGCNA’ success...

问题 16S FastMap文件如何填写能否像详细讲解一下，视频中说tap1文件就是ckd就是肾病患者的简称填写吗，我搜到的是tap列通常用于记录与每个样品关联的分类工具或方法的信息。像这样，能否详细说明一下

...r sample from river S3 BC3 F341 Control MOTHUR v.1.45.1 with SILVA SSU Ref NR99 Sediment sample from lake