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文章 11月8日见刊(IF=4.5)水稻U-box E3基因家族分析文献解析

...靶蛋白的特异性识别,能够将泛素分子连接到靶蛋白的某赖氨酸上,在泛素途径中具有重要的作用。 文章结果内容 1. 水稻中U-box E3泛素连接酶(OsPUBs)染色体分布 2008年li-rong-zheng等已经报道了在水稻中鉴定的77U-box E3泛素...

文章 转录组分析基因注释常用的数据库

... 5、KEGG:翻译成中文是京都基因与基因组百科全书,是一整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库,旨在揭示生命现象的遗传与化学蓝图。它是由人工创建的一知识库, KEGG 数据库最优的地方在于拥有描绘已知通路的代...

问题 Meme搜索蛋白motif网页结果显示与TB-tools打开.xlm文件的不一致

老师,您好! 我正在用meme搜索蛋白质的motif,发现motif网页结果显示与TB-tools打开.xlm文件的不一致 以下为网页结果:看下面红色方框里面的3 以下为tb-tools结果:看下面红色方框里面的3 还望老师赐教,谢谢!

文章 华西博士3年发46篇SCI论文,论文高产的秘诀你知道吗?

...且头发还那么浓密? 所谓人红是非多, 果不其然,这邓学霸就因为论文“高产”遭到了很多的讨论乃至非议。 想要“质疑”别人,首先得拿出“证据”来, 学霸姐姐作为一只柠檬精,去搜索了一下邓同学的46篇文章, 发...

文章 群落分析的冗余分析(RDA)概述

...析(NMDS)。这些排序方法均属于非约束排序,只涉及一数据矩阵,并在低维空间中尽可能呈现原始的数据结构。非约束排序方法中不存在解释变量(对于物种多度数据而言,解释变量通常指代环境因素),尽管可以通过相关...

文章 R语言宽型与长型数据转换tidyr包

...结合使用,目前渐有取代reshape2包之势, 是值得关注的一R包。 在tidyr包中,有四常用的函数,分别是: gather():宽数据转换为长数据,将行聚集成列spread():长数据转换为宽数据,将列展开为行unite():多列合并为一列separate...

文章 STRING蛋白互作网络图绘制及子网络分析

...达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各环节,能够系统分析大量基因在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中各成分的工作原理,了解疾病等特殊生理状态下生物信号和能量物质代谢的反应机制,...

问题 建立索引时报错,有很多关于mRNA的错误输出文件为部分为0KB

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文章 分组柱状图添加误差线(位置)--ggplot2

分组柱状图的绘制可以基于ggplot2,具体可以参考: 分组柱状图--ggplot2 。 如何针对分组柱状图添加误差线并合理调整位置呢?主要基于geom_errorbar及其参数position进行细节调整。 譬如基于上述链接数据增加一列标准差SD,进行演...

文章 怎样画多物种基因家族共线性分析图?

...流。” 趁着三四月各地油菜花香的好时节,小编也应景,给大家带来一篇2023年初发表题为《Identifi cation and phylogenetic analysis of R2R3-MYB subfamily in Brassica napus》的文章,但本文今天重点给大家介绍这篇文章中作者是如何展示油...

文章 重磅:全球科学家排行榜出炉!中国科学家排名最高的是......

...有70多亿人口,在这么多人里面,总共有多少科学家? 这答案,学霸姐姐也无从知晓。。。 但是,可以确定的是,这种跨国家、跨领域、跨时间的人排名,一定是没那么好对比的。 虽然科睿唯安每年都会发布高被引学者...

文章 25天破解“粮食杀手”草地贪夜蛾基因组

...难,自2019年1月首次在境内被观测到至6月底,已经在近20省份1000多县被发现,涉及作物面积500万亩! 它就是草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda),今年已多次被国务院和农业部点名警示,7月份农业部还印发了《全国草地贪夜...

问题 老师,我想请教一下,在鉴定基因家族成员时,如果此类基因家族的典型结构域有三比如说A,B,C,我看文献上已鉴定出来的此类家族一般成员同时含A,B,C;或者含A,B;或者B,C就说明是属于这基因家族的,但是鉴定的时候有时候会出现A,B,D这种情况应该怎么办呢,因为出现了别的结构域D

文章 相关性分析及散点图绘制-脚本使用

...的文献中,作者大量地进行相关性分析并绘制了散点图,更好地展示了相关性分析的结果。 下图是文献中免疫相关预后评分(IRPS)与一些决定肿瘤免疫原性的潜在因素(如突变负荷、同源重组缺陷等)的相关性散点图,并且作者在...

问题 GWAS分析绘制进化树遇到下面问题是什么意思,请问怎么解决?

[root@9adc3a3663e0  00:27:42 /work/my_gwas/01.phylo_tree]# ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROU                                                                                                 P -g Group -n fasttree WARNING: ignoring environment value o...