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文章 Linux 服务器 安装Jupyter notebook 并开启远程访问

一. centos下安装jupyter notebook1. 使用Anaconda安装conda install jupyter notebook 2. 使用pip安装pip install jupyter notebook 二. Jupyter notebook 配置1. 生成配置文件jupyter notebook --generate-config 2. 创建密码使用python中的passwd()创建密码，终端输入ipython...

文章 百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go用法

常使用linux，但仍然需要百度网盘和外界进行沟通的用户一定知道bypy，不过遗憾的是，这个软件python写的软件太过缓慢，不过我最近发现了一个软件，BaiduPCS-Go 他用go编写，几乎像是百度网盘linux版一样好用 在官网找自己服务...

文章 perl脚本批量生成反向互补序列

...量处理序列。 用法： perl  fasta_Reverse_complementary.pl  -fa input.fa  -out out.fa input.fa是输入文件，out.fa是反向互补后的序列 输入文件格式入下所示： >bta-26a-2GGCUGUGGCUGGAUUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCUGUUUCCAUCUGUGAGGCCUAUUCUUGAUUACUUGUUUCUGGAGGCAGCU>bta-...

文章 使用map()、filter()来做到函数式编程

...改变引用值， 但普通函数会，举个例子 def num_1(list):for index in range(0, len(list)): list[index] += 1return listlst_1=[1,2,3]print(num_1(lst_1))print(num_1(lst_1)) [2, 3, 4] [3, 4, 5] 这个普通函数经过2次调用，让lst_1这个列表的值发生了变化，那...

文章 群落分析的冗余分析（RDA）概述

.... Numerical Ecology. Second English edition. Developments in Environmental Modelling, 1998, 20, Elsevier Mccune B P, Grace J B. Analysis of Ecological Communities. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2002, 289(2). Rao C R. The use and interpretation of principal component analysis in...

问题 在MCScan中报错

在MCScan中报错Exception in thread "main" java.lang.NullPointerExceptionat family_circle_plotter.paint(family_circle_plotter.java:197)at family_circle_plotter.main(family_circle_plotter.java:334)请问您是怎么解决的

文章 R脚本报错|URL 'https://raw.githubusercontent.com/YinLiLin/R-CMplot/master/R/CMplot.r': Timeout of 60 seconds was reached

...本的时候，出现报错，提示CMplot这个包连接超时。 Error in file(filename, "r", encoding = encoding) :  cannot open the connection to 'https://raw.githubusercontent.com/YinLiLin/R-CMplot/master/R/CMplot.r'Calls: source -> fileIn addition: Warning message:In file(filename, "r", e...

文章 compare_stat_boxplot.r metadata中变量分组T检验比较并绘制box图

...       [-y ylab] [-o path] [-n prefix] [-H number] [-W number]box plot and stat :optional arguments:  -h, --help            show this help message and exit  -m filepath, --metadata filepath                        input metadata file path[required]  -v variate [variate ...], ...

文章 相关性分析及散点图绘制-脚本使用

...r plot optional arguments: -h, --help show this help message and exit -m meta, --meta meta Input contains two columns of data for calculating the correlation[required] -n name, --name name Specifies the column name of the column[opt...

文章 Plant Communications | 浙大团队解析比克氏棉全基因组进化规律及其色素腺体和棉酚形成机制

...发表了题为“A reference-grade genome assembly for Gossypium bickii and insights into its genome evolution and formation of pigment gland and gossypol”的研究论文。该文解析了具有“子叶色素腺体延缓形成”性状的野生棉种比克氏棉（Gossypium bickii，G1）的全...

问题 安装WGCNA编辑包出现如下问题怎么解决？

Error in biocLite(c("GO.db", "preprocessCore", "impute")) :    could not find function "biocLite"

问题 16s分析导入数据遇到同样的问题，请问您解决了吗?

...is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:   Filepath on line 3 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($datadir/AWGB16SAA2134120-38-28_R1.fq.gz) for sample "AWGB16SAA2134132-38-28".

文章 R语言基础入门—判断语句

...的代码，如果 为 false 则不执行。 实例 x <- 50Lif(is.integer(x)) {   print("X 是一个整数")} 执行以上代码，输出结果为： [1] "X 是一个整数" if...else语句 一个 if 语句后可跟一个可选的 else 语句，else 语句在布尔表达式为假...

问题 eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

...icate but has an ID already used. /!\ AGAT might mix up the child features and create chimeric records. Indeed we changed the ID for this L1 feature to be unique but we do not change the Parent attribute of the child features to reflect this change. Why? because we do not know to which L1 the child ...

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

...      omicsclass/sratoolkit          SRAtoolkit v2.10.3 and aspera v3.9.9.177872     0                  omicsclass/ampliseq-q2         Amplicon sequencing qiime2 v2020.2 image        0                  omicsclass/ampli...