...的方法，并附上配色方案供大家参考。大家也可以到网上搜索其他的配色方案。 使用的是修改注册表的方法。 1.打开注册表：运行——》regedit 2.找到对应的注册表文件，并导出：注册表地址 HKEY_CURRENT_USER\Software\SimonTatham\PuTTY\...
...的出现打破了这种格局，CPU 资源按时间片被分割开来，分配给不同的进程使用。这样一来，从微观上看进程的执行虽然仍是串行的，但是从宏观上看，不同的程序已经是在并行执行了。如果我们把同样的思想运用到进程上，很...
使用ggplot2绘制气泡图 已预先设置阈值/标签 enrich = 0.01minPvalue=1e-15xlab=""ylab="Rich factor"title=""color="-log10(Pvaule)"size="DEGs" 使用geom_point（）函数进行点的颜色/大小映射 当aes中写之前定义的标签名时 kegg_point<-ggplot(kegg,aes...
MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解，是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具，结果输出一般是有四个文件，motif的图形展示文件（LOGO），txt文本，html的网页信息文件及xml格式文件。 html文件主要包含两部分信息：其一...
...一下比对率，这个阈值设多少合适呢？或者有什么更好的筛选办法吗？谢谢
...-type=mRNA --key=Name Tcacao_233_gene.gff3.gz -o cacao.bed 2.共线性搜索 $ python -m jcvi.compara.catalog ortholog peach cacao --cscore=.99$ python -m jcvi.compara.synteny screen --minspan=30 --simple peach.cacao.anchors peach.cacao.anchors.new 这样我们就得到cacao.be...
...录了所有原始数据文件的总体信息；evidence.txt文件记录了已鉴定肽段的所有信息。每个文件的列数（表头）都很多，就不一一列举了，需详细了解的同学可自行查阅结果中tables.pdf文件，所有文件都有详细解释。 好了今天先介绍...
...个节点的分支长度来确定外,树上其余节点都确定,最后是剩余的2个的分支长度Sy=Dij 第三种：最大简约法(Maximum Parsimony Method) 最大简约法的理论基础是奥卡姆（Ockham）哲学原则，这个原则认为：解释一个过程的最好理论是所需假...
...以下10个分析技能，您也能写一篇基因家族的文章啦！1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域，鉴定基因家族成员；2、预测基因家族成员的顺势作用元件；3、构建系统进化发育树；4、基因家族成员MOTIF分析及绘图；5、基因结构图...
...，只是这最近是第一次跌到3分以下。 中国来源稿件：13.81% 细胞生物学(3区)/生物化学与分子生物学(3区) 版面费：选择非OA不付费，OA则需付费 平均审稿周期：也是比较快、好说话。 声明一下，以上这3个期刊，都不是水刊，...
按老师给的代码，提取差异基因，遇到问题（黑体字已标出） fdr = 0.05 fold_change = 2# 读取基因表达的矩阵rawdata<-read.table("Gene_HTSeq_Counts.txt", header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE, row.names=1)# 针对基因的表达量进行过滤，过滤标准设置为...
...难发，想必广大科研工作者都深有体会。时光飞逝，年假已匆匆过去，一年的辛勤劳动又开始了，不知今年转录组文章发表乐不乐观呢？下面小编以一篇2018年1月31日发表在《BMC Genomics》上的转录组文章为例来和大家一起探讨下...
...员，而是先到先得。比方说：u1、u2、u3都属于bbs组，给bbs分配了100M的空间，假如u1下载了太多的种子文件，u2和u3就没有空间给他们使用了。 2、目录配额： 目录配额指的是限制目录在分区中所占用的磁盘空间大小的限制，任何...
...s 离散特征法：基于离散特征的系统发育树重构算法通过搜索各种可能的树，从中选出最能够解释物种之间进化关系的系统发育关系树，这类方法可以使用各种核酸和氨基酸替换模型。 从计算速度来看，最快的是基于距离的...
...能发基因家族文章吗，答案是肯定可以的，刚刚到pubmed上搜索了一下，发的文章还是挺多的： 基因家族分析作为低投入高产出的发文思路，受到广泛关注，分析的人也越来越多，我们也对基因家族分析课程针对之前学员经常...