...的出现打破了这种格局，CPU 资源按时间片被分割开来，分配给不同的进程使用。这样一来，从微观上看进程的执行虽然仍是串行的，但是从宏观上看，不同的程序已经是在并行执行了。如果我们把同样的思想运用到进程上，很...
...知模板进行定量分析的方法。 目前，实时荧光定量 PCR 已成为不同样品间进行基因表达水平定量差异比较的权威性方法。在过去十几年中，该方法迅速流行，涉及科学的多个领域，包括农业、环境、工业和医学研究。 实时荧...
...究、生信基础（Linux、Python、R、Perl）等方向，学员数量已超过70000人！多门课程被推送到网易云课堂首页推荐位，并在网易官方的金云奖评选中荣获平台潜力奖及严选口碑机构，我们也是唯一入选的生物信息类团队！ 全年最大...
...一下比对率，这个阈值设多少合适呢？或者有什么更好的筛选办法吗？谢谢
MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解，是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具，结果输出一般是有四个文件，motif的图形展示文件（LOGO），txt文本，html的网页信息文件及xml格式文件。 html文件主要包含两部分信息：其一...
...，只是这最近是第一次跌到3分以下。 中国来源稿件：13.81% 细胞生物学(3区)/生物化学与分子生物学(3区) 版面费：选择非OA不付费，OA则需付费 平均审稿周期：也是比较快、好说话。 声明一下，以上这3个期刊，都不是水刊，...
...-type=mRNA --key=Name Tcacao_233_gene.gff3.gz -o cacao.bed 2.共线性搜索 $ python -m jcvi.compara.catalog ortholog peach cacao --cscore=.99$ python -m jcvi.compara.synteny screen --minspan=30 --simple peach.cacao.anchors peach.cacao.anchors.new 这样我们就得到cacao.be...
...个节点的分支长度来确定外,树上其余节点都确定,最后是剩余的2个的分支长度Sy=Dij 第三种：最大简约法(Maximum Parsimony Method) 最大简约法的理论基础是奥卡姆（Ockham）哲学原则，这个原则认为：解释一个过程的最好理论是所需假...
使用ggplot2绘制气泡图 已预先设置阈值/标签 enrich = 0.01minPvalue=1e-15xlab=""ylab="Rich factor"title=""color="-log10(Pvaule)"size="DEGs" 使用geom_point（）函数进行点的颜色/大小映射 当aes中写之前定义的标签名时 kegg_point<-ggplot(kegg,aes...
...以下10个分析技能，您也能写一篇基因家族的文章啦！1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域，鉴定基因家族成员；2、预测基因家族成员的顺势作用元件；3、构建系统进化发育树；4、基因家族成员MOTIF分析及绘图；5、基因结构图...
...U-box E3泛素连接酶（OsPUBs）染色体分布 2008年li-rong-zheng等已经报道了在水稻中鉴定的77个U-box E3泛素连接酶基因（OsPUBs），但基因家族分析内容涉及不是太多，详见原文：https://www.cell.com/molecular-plant/pdf/S1674-2052(14)60357-9.pdf。 所以...
...s 离散特征法：基于离散特征的系统发育树重构算法通过搜索各种可能的树，从中选出最能够解释物种之间进化关系的系统发育关系树，这类方法可以使用各种核酸和氨基酸替换模型。 从计算速度来看，最快的是基于距离的...
...“基因家族分析还能发文章吗？”当你还在犹豫时，人家已经向2区期刊进发了！今天给大家分享一篇2021年7月8日（上周四）发表于BMC Plant Biology（2区，IF=3.497）题为“Genome-wide analysis of MYB transcription factors and their responses to salt str...
...影响。 这与之前讲述的GO富集分析不同。GO富集分析是先筛选差异基因，再判断差异基因在哪些注释的通路存在富集；这涉及到阈值的设定，存在一定主观性并且只能用于表达变化较大的基因，即我们定义的显著差异基因。而GSE...
...员，而是先到先得。比方说：u1、u2、u3都属于bbs组，给bbs分配了100M的空间，假如u1下载了太多的种子文件，u2和u3就没有空间给他们使用了。 2、目录配额： 目录配额指的是限制目录在分区中所占用的磁盘空间大小的限制，任何...