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问题 各位老师好，经过过滤低丰度和低共有的OTU表格还需要抽平吗？

到手的OTU表格各样本间的read数量一致，经过过滤低丰度和低共有OTU后，还需要抽平一次吗？

问题 conda update CondaHTTPError: HTTP None

已经添加清华的镜像： channels:   - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/   - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/   - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/   - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs...

问题 基因组注释解压 database.tar.gz.* 问题

... Child returned status 1 tar: Error is not recoverable: exiting now 我的做法是 cat database.tar.gz.* > database.tar.gz， tar zxvf database.tar.gz，后面我去掉 -z 参数，依然报该错误，而且服务器中是已经安装了 gzip 包的，请问老师该如何解决？

问题 老师，请问做共线性图只得到半圆，是什么原因？谢谢！

染色体数据、ID都对应，得到的共线性图也都包含这些染色体，为什么是半圆，请问是不是配置文件没做对？1630307487(1).png1630307621(1).png1630307669(1).png1630307727(1).png1630308394(1).png1630308440(1).png5bb552e4908b4b5c43a36aee4bdfff8.png

文章 docker配置国内源加速下载，linux版本

..."https://docker.mirrors.ustc.edu.cn" ] } 注：需确认"daemon.json"的位置。 3、重启 Docker 服务 sudo systemctl restart docker

问题 ggplot2画图

我的脚本 library('ggplot2') ##工作目录ã€æ–‡ä»¶è®¾ç½? getwd() workdir="D:/ggplot2/enrich" gofile="D:/ggplot2/enrich/GO.Enrichment.txt" setwd(workdir) ##相关阈值ã€æ ‡ç­¾è®¾ç½? enrich=0.05 minFDR = 1e-15 xlab="GO_N...

问题 PUTTY中kaks计算显示Checking Epal2nal.pl: [NA]

前面几个步骤都没问题，出来的文件也都正常，也检查了全局变量，请问该怎么改？

问题 染色体较长的在HaplotypeCaller这一步完了以后应该怎么建立索引？

...这一步报错了，所以我就没有构建索引但是想要CombineGVCFs的话必须有索引文件，我应该怎么建立呢？（尝试了gatk IndexFeatureFile 和bcftools -t都因为太长步支持，又尝试了bcftools -c可是这个建立的索引CombineGVCFs不识别）

文章 R的几个内置常量

...几个内置常量，方便我们直接调用而非创建： 想要了解R的内置常量，可以?Constants 命令查询： ?Constants 其常量如下： 1、26个字母LETTERS, 小写字母怎么办？ 有letters > LETTERS [1] "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "J" "K" "...

问题 Agilent单色背景校正，Error in if (alpha

...做agilent单色芯片背景校正时，到Array5时报错，删掉array5的文件后，其他芯片全正常。 > BgCorrect=backgroundCorrect(EListRaw,method = "normexp",normexp.method = "rma",offset = 50) Array 1 corrected Array 2 corrected Array 3 corrected Array 4 corrected Array 5Error...

问题 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

运行另外一个样是正常的，另外一个样是3个处理，3个重复，这个样是4个处理，3个重复 这是分组文件

文章 perl对文件夹处理

...me = readdir(DIR))){print("$filenamen");       #循环输出该目录下的文件。### do something ###}closedir(DIR);   例 把每个文件复制一次： #!/usr/bin/perl use warnings;use strict;my (%h, $filename);my $dirname="/home/bmk/";opendir (DIR, $dirname)|| die "Err...

问题 绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误，请老师指教

程序正常运行 这是最后的结果 GFF源文件 请老师指教，谢谢！

文章 grep 两个文件内容取交集

利用grep 筛选两个文件中共有的信息 N.txt cat N.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011034_P001 C.txt cat C.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011035_P001 N.txt 和C.txt 的交集gre...

问题 WGCNA中绘制性状与模块相关性图出现colorMatrix[, c] : incorrect number of dimensions

之前完全没问题，绘图时出现错误 数据内容如下： 性状数据内容： textMatrix矩阵内容： 实在是不知道到底哪个矩阵的维度不对了...