8 Agilent单色背景校正,Error in if (alpha <= 0) stop("alpha must be positive")

老师好,在做agilent单色芯片背景校正时,到Array5时报错,删掉array5的文件后,其他芯片全正常。

> BgCorrect=backgroundCorrect(EListRaw,method = "normexp",normexp.method = "rma",offset = 50)

Array 1 corrected

Array 2 corrected

Array 3 corrected

Array 4 corrected

Array 5Error in if (alpha <= 0) stop("alpha must be positive") : 

  missing value where TRUE/FALSE needed

In addition: Warning message:

In log(out$alpha) : NaNs produced

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1 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

不太肯定问题 应该是芯片出现看负值之类的,尝试修改一下参数方法或者参数值试试  backgroundCorrect参数中的方法可能比较限制这一点:

attachments-2019-08-tjfZwEa05d47a19c72bcc.jpg

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  • Gordon 提出于 2019-08-04 15:04

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