绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误,请老师指教

attachments-2019-02-lgzjto2V5c70f56ac7958.jpg程序正常运行

attachments-2019-02-7INXxolm5c70f58d3c586.jpg这是最后的结果

attachments-2019-02-PKaHg8BL5c70f59e294d2.jpgGFF源文件


请老师指教,谢谢!

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

程序没有出错,读取的是以下ID,你截图的部分gffread不会读取:

attachments-2019-02-zuWmhb415c71f201f0f23.jpg

尽量不要在NCBI上下载基因组注释信息,后期不好处理;

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安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

ncbi数据库基因组基因ID与我们熟悉的不太一样,建议别用。

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  • clcprince 提出于 2019-02-23 15:27

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