ggplot2画图

我的脚本

library('ggplot2')


##工作目录ã€æ–‡ä»¶è®¾ç½?

getwd()


workdir="D:/ggplot2/enrich"

gofile="D:/ggplot2/enrich/GO.Enrichment.txt"

setwd(workdir)


##相关阈值ã€æ ‡ç­¾è®¾ç½?

enrich=0.05

minFDR = 1e-15


xlab="GO_Name"

ylab="-log10(FDR)"

fill="Class"

title="A-F VS P-F "


##读å–æ•°æ®

demo_go=read.table(gofile,sep="\t",check.names = F,header = T,comment.char = "")

head(demo_go)

我输入需要做图的enrichment .txt

attachments-2020-10-P1UWs9EA5f89041d48141.png
报错如图attachments-2020-10-ZK7nWSkf5f87a550189be.pngattachments-2020-10-VMSBBeCQ5f87a58553d80.png 请问哪里出了问题



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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

输入文件格式有问题吧,输入文件应该是文本文件才可以。


不用出现引号
attachments-2020-10-Fs2HAFwE5f8903d7f0359.png

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