话题 单细胞转录组差异基因KEGG富集分析

问题 想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

因为.TEM数据大概319MB，高达300万行数据，excel不能完全打开，R不能读取全部。所以应该怎么实现？

问题 向管理员要了metagenomics：v1.0的本地镜像，但是输入 docker load -i metagenomics-v1.0.tar.gz后一直报错 open /var/lib/docker/tmp/docker-import-2588968250/metagenomics/json: no such file or directory

问题 人培养细胞做转录组需要多大量的样品。

文章 空间转录组细胞分割

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文章 fastq文件查看指定序列

...处理fastq文件时，可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题，这时候软件会报告哪条序列有问题，并给出序列ID，然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是，fastq文件通常是很大的，使用less命令可能很难搜...

文章 碰到奇葩审稿人怎么办？这位作者靠怒怼审稿人登上SCI期刊！

...是要改的， 但是，如果你实在不认可审稿人提出的意见怎么办？ 这里有几种情况跟大家分别说一下： 情况1，虽然不认可，但是属于可改可不改的问题： 心一横，还是从了审稿人吧, 可以不痛不痒的先说个We appreciate the comment...

文章 SMB1.0客户端导致的网络驱动器(群辉NAS存储)上的文件无法打开查看编辑等问题（win10)

登陆网络共享存储，找到预处理的文件，结果发现文件打不开，无法编辑，甚至拷贝都出现权限受限问题。但是查看整个权限设置一点问题都没有~~~why? 切换到其他电脑上进行登陆，又没有这个问题了————可能是PC端...

问题 单细胞测序cellranger分析

显示磁盘已满，进行报错，第二个样本中跑不出来out文件夹且比第一个样本中少东西，新建不了文件夹，后续进行不了，麻烦问一下老师怎样解决

文章 胃癌预后signature数据挖掘-自噬基因

背景：自噬是真核细胞中一种高度保守的细胞生物学行为，是细胞内包裹细胞质成分的双层膜结构形成并与溶酶体结合产生自我吞噬性质的一种分解代谢过程。自噬的分解代谢作用可以清除细胞内的毒性物质，维持细胞内环境稳...

问题 老师，我的电脑是win10家庭版，然后按您给的方法安装docker的时候需要先设置一下Hyper-V，但是我在以管理员身份运行Hyper-v.cmd时，运行过程一直卡在这一步，没有显示百分比，试过好几次了，一直是这样。

问题 猪单细胞数据差异基因KEGG富集分析

根据老师提供的单细胞转录组课程、有参转录组课程和代码，对KEGG富集分析的代码进修修改，执行此代码Rscript $scripts/enrichKEGG_pip.r --gene.list FindMarkers.deg.Enterocyte.AvsB.tsv -o KEGG -n deg.Enterocyte.AvsB --pvalueCutoff 0.05 --ann.db org.Ss.eg.db --orga...

问题 新上新的单细胞转录组课程可以用于华大测序平台分析

新上新的单细胞转录组课程中的质控分析课程中的封装好的R脚本可以用于华大测序平台的质控吗？可以的话能否展示一下如何使用，具体的调整哪些参数？

文章 如何写出好的 Skill

...符就出问题，你不能让 AI 自由发挥，必须用脚本来锁死格式——这就是低自由度。这类任务叫"脆弱操作"：不是说它复杂，而是说它做对只有一种方式，做错有一百种方式。 这解决了"怎么在 AI 的灵活性和输出的可靠性之间取...

文章 MUSCLE软件介绍

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...