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问题 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

运行另外一个样是正常的，另外一个样是3个处理，3个重复，这个样是4个处理，3个重复 这是分组文件

文章 perl对文件夹处理

...me = readdir(DIR))){print("$filenamen");       #循环输出该目录下的文件。### do something ###}closedir(DIR);   例 把每个文件复制一次： #!/usr/bin/perl use warnings;use strict;my (%h, $filename);my $dirname="/home/bmk/";opendir (DIR, $dirname)|| die "Err...

问题 绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误，请老师指教

程序正常运行 这是最后的结果 GFF源文件 请老师指教，谢谢！

文章 grep 两个文件内容取交集

利用grep 筛选两个文件中共有的信息 N.txt cat N.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011034_P001 C.txt cat C.txtZm00001d003640_P001Zm00001d003640_P002Zm00001d003640_P003Zm00001d010870_P001Zm00001d011035_P001 N.txt 和C.txt 的交集gre...

问题 WGCNA中绘制性状与模块相关性图出现colorMatrix[, c] : incorrect number of dimensions

之前完全没问题，绘图时出现错误 数据内容如下： 性状数据内容： textMatrix矩阵内容： 实在是不知道到底哪个矩阵的维度不对了...

问题 Linux服务器上安装R之后，在R环境下利用githubinstall安装QTLseqr出现问题，如何解决

利用githubinstall 安装github上的QTLseqr（老师介绍的），出现如下错误，应该怎么办呢

问题 黄老师，用的你在github上的qtlseq，运用原始数据，从cleanreads开始运行qtlseq，出现以下错误，请问该如何解决

qtlseq是用conda安装的

问题 Use of uninitialized value $l in numeric lt (

bcftools mpileup -Ou -f 02428.genome.fa I662_sorted_dedup_reads_realigned.bam.recal.bam| bcftools call -c| vcfutils.pl vcf2fq -d 10 -D 100 | gzip > 3dilpoid.fq.gz 做PSMC的准备文件vcfutils.pl vcf2fq总是报错Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566. 

问题 Mac中RStudio安装XLConnectJars包出错

> library(XLConnect)载入需要的程辑包：XLConnectJarsError: package or namespace load failed for ‘XLConnectJars’: loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了，详细内容：  调用: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)  错误: 无法载入共享目标对象‘/Library/Fram...

问题 提取蛋白编号信息

cp @omicsgene 老师，按照视频的脚本仔细核对没有错误，编译执行后也有没有报错，但pep.fa文件一直是空，文件名字没有空格，是不是文件读取权限向题 如果脚本有问题，编译起来就会报错，还得请教老师来解决，谢谢 use...

问题 执行fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc报错

...Linux系统，并把内存改为9G时候，仍然报错，与上述一样的错误，

问题 运行docker时出现了以下错误（The system cannot find the file specified... ，重装了一遍）

第一遍装时应该是正常的，重装之后出现了以下错误，怎么破？

问题 运行docker时出现了以下错误（The system cannot find the file specified... ，重装了一遍）

第一遍装时应该是正常的，重装之后出现了以下错误，怎么破？

问题 群体遗传学GWAS课程docker很多命令无法运行

...e Used [perl  ../bin/Plot_XX.pl ] to Plot the LDdecay 只能产生很小的结果文件，前面也有一些命令运行不了

文章 遗传进化英文方法参考

...old was set as 1/n (n, total SNP number).     基因组重测序数据分析视频课程：https://study.163.com/course/introduction/1210221805.htm?share=1&shareId=1030291076或者扫码二维码：     Reference [1] Li H, Durbin R. Fast and accurate short read alignment with Burrows...