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问题 绘制转录本图，无法提取文件

老师，您好 在绘制转录本图时出现下列问题： 输入此命令：perl /home/manager/share/script/get_gtf.pl -in1 gene2_id.txt -in2 Gossypium_hirsutum_v1.1.gene.gtf -out u-box_gtf.txt，输出的 u-box_gtf.txt文件是空的，是什么原因？

问题 MutMap_framework1.4.4

http://genome-e.ibrc.or.jp/home/bioinformatics-team/mutmap 需要下载MutMap Pipeline（MutMap_framework1.4.4.tar.gz），但这个网站好像下载不下来了，请问哪位有没有保存的给我发一份，万分感谢。

问题 获得结构域后进行clustalw比对没有结果

获得基因家族结构域序列后，进行clustalw序列比对，出现错误。 我的结构域的序列为： 分步进行多序列比对 输入clustalw命令 选择1，输入文件 输入2进行比对 输入1 提示没有序列。

问题 用iTOL美化进化树时出现如下问题，求解答。

修改分支颜色时，就显示如右上角无法保存修改，拖拽数据时，也显示无法识别，用自己的文件和实例文件都是这样，求解答。

问题 GeMoMa报错

我从NCBI上下的基因组序列fa文件和gff文件，在运行时报错java.lang.IllegalArgumentException: You selected cdsParts=true, but the ID (gene-si:)seems to be no CDS part.Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: Did not finish as intended. java.lang.IllegalArgumentExceptio...

问题 安装docker时有个步骤需要“以管理员身份运行”

安装docker时有个步骤需要“以管理员身份运行”，但是我的电脑上没有这个选项是什么情况？

问题 遗传图谱构建中群体SNP检测与开发

我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序，想通过该数据构建遗传图谱，但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤，这个是如何过滤的？能不能和子代数据一起过滤？

问题 老师您好，我在hisat2建立索引时报错，向您求助

尝试过两个数据库的fasta文件，都不行，这是怎么回事呢

文章 awk统计某列中文本次数

统计下面文本中，第一列文本出现的次数（第2列没什么意义） gene    1cds    2gene    3gene    4rna    5cds    6 awk命令如下： awk  '{sum[$1]++}END{for(i in sum) print i "\t" sum[i]}' example.txt 结果如下： cds     2rna     1gene    3

问题 为什么基因表达量进行标准化之后会有负值

标准化之后的表达量：

问题 跑WGCNA，用的独享服务器，报错

[root@dd38db80c194  21:48:53 /work/my_rnaseq/R]# Rscript WGCNA.R.R 运行WGCNA脚本，报错，公司的独享服务器，29484个基因

文章 错误：perl: warning: Please check that your locale settings: LANGUAGE = (unset), LC_ALL = (unset), LC_CTYPE = "UTF-8", LANG = "en_US.UTF-8"

计算机连接服务器并使用perl的时候，可能会报上述错误 这个时候，你需要在主机上的 ~/.bashrc 或 ~/.bash_profile 文件加上下面的参数， # Setting for the new UTF-8 terminal support in Lion export LC_CTYPE=en_US.UTF-8 export LC_ALL=en_US.UTF-8 如果...

问题 python文件运行时提示找不到gff fasta文件

我在使用python IDLE 运行附件提供的python程序时，每次运行都提示找不到所需的gff fasta文件。

问题 比较基因组学分析时报错，无法生成 anchors文件

老师您好！附图是报错的截图和报错后生成的几个文件 生成了几个文件 请老师指点！感谢！！

问题 用三代测序测全长转录组，样品准备有什么不同吗？

近期课题组需要做些全长转录组，不知道RNA需要量和做普通的二代转录组有啥区别呢？