问题 plink 报错

Error: --set-missing-var-ids requires a sorted .bim file.  Retry this command after using --make-bed 之前的vcf文件运行用样的命令就不会出错呢，这难道是vcf文件位置顺序不对？

问题 获得初步基因家族基因列表出错

raw_IDlist获得的基因个数与hmmerOut_cutEValue文件的基因个数不同

文章 geo_gene_exp_download.r GEO数据自动下载与整理

...新标准化： 可以通过boxplot函数观察一下样本表达丰度值的分布是否整齐进行判断 是否需要log2:根据数据值的大小： 如果表达丰度的数值在50以内，通常是经过log2转化的。如果数字在几百几千，则是未经转化的。使用过程中常见...

文章 docker clash 配置

...clash-core/releases配置文件:config.yaml或者在您当前clash目录下的 config.yaml里面放着clash的借口,控制参数，链接信息等ip数据库Country.mmdb启动程序后会自动下载,或者在您当前clash目录下 1.下载客户端 执行 cd && mkdir clash 在用户...

问题 在T2T基因组直播课程中基因组hic挂载染色体部分，老师说对于高杂合基因组还需要用一个软件过滤等位基因假信号，是什么软件，我没听清；还有个问题如果只用nextdenevo进行数据校正不组装，那么校正后的数据在哪个文件夹？

问题 染色体位置

老师，我在做基因染色体位置绘图时，把需要的信息输入后，为什么网站一直不出结果，显示这样的画面？http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/

问题 请问提取基因CDS位置时，用蛋白序列ID（NP开头）无法提取，但是用mRNAID（NM）可以提取？

我用蛋白序列id无法提取出来的文件是空的，但是我用mRNA ID可以提取出来，请问为什么？(我下载的的蛋白fa文件使用每行开头是>XP，不知道是否有影响)。

问题 MAGEcc跑进化树

老师您好！我用linux的megacc构建进化树，在.mao文件中设置的线程数是最大值40，然而，在运行过程中，一直只是一个线程运行，实在太慢了。请问这是咋回事？

问题 data_qc处理

进行data_qc处理时有一个样本的文件无法打开 其他样本都是正常的 这是什么原因

问题 megacc运行很慢

老师您好，上次跟您提到的megacc运行很慢，命名设置了40线程，但是在服务器中也就一个线程在跑，不知是何原因。您让我提供mao的截图，请看下图

问题 genome

我想问一下，下载山羊基因组的时候，gff文件有两个一个Capra_hircus.ARS1.113.chr.gff3.gz， 一个是Capra_hircus.ARS1.113.gff3.gz， 我想问一下这个两个有什么区别，我如果比对重测序数据的话，下载哪个比较好？

问题 进化树美化问题

在进化树美化中设置branch color，bg color时，输入指令的时候基因名称没有下划线（比如XP 020701573.1）也可以输出结果，但为什么在加入分组的时候必须把下划线加上（XP_020701573.1）才能正常显示？

问题 GATK硬标记过滤速度慢

老师好，请问如果加快GATK硬标记过滤的速度，发现一天几乎是只生成1-2G的数据，太慢了

问题 老师好！有个问题想请教一下: 之前选做的几个基因是根据旧版数据库里的CDs序列克隆的，现在数据库更新了，要求用新版数据库，但是新旧版数据库ID对不上，遇到这种怎么办呀？（基因数量比较好多，没办法一个一个blast来比对）

问题 关于MSCanX画图问题

老师您好，就是我在用python版本的MSCanX画图时用的是蛋白序列，然后输入命令出来的结果如下图 是只能用cds序列进行比对吗，而蛋白序列在这里面不可以。请老师解答。