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文章 GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

...网页中会有具体的解释，根据解释理解即可 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...组学生物愿与诸君携手共进，共攀科研高峰！ 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

...异（SNP，indel，SV，CNV）的主要手段之一，有了这些变异信息，后续可以做很多分析工作，例如: 遗传群体可以进行遗传图谱构建、BSA分析等；大样本量自然群体，可以进行群体遗传进化分析等。今天，小编先给大家群体遗传进化...

文章 ggplot2几何设置——geom

...图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

问题 请问我在运行基因上游顺势作用元件分析时出现以下问题，如何解决？

运行到提取上游序列的时候出现这样的情况我的位置信息是这样的： 基因组格式是这样的：

问题 如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因？

目前已经知道了p值显著的位点信息（几号染色体及位置），下一步该如何做呢？是要去参考基因组的gff文件中找到snp位点附近是否有基因吗，获得基因编号后要去什么文件中进行检索，不知道文章中曼哈顿图上标注的基因都是...

文章 全外显子测序疾病相关基因变异位点过滤标准及参考文献

...f Medical Genetics and Genomics." Genet Med 19(2): 249-255. 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

问题 如何修改perl脚本从cds文件中提取上游序列呢？（有些cds中的scaffold可能不足1500）

...调控元件 但目前研究的物种并没有完整的染色体基因组信息 （下面是拟南芥的，完整的基因组信息） （下面是我研究的物种的，只有scaffold片段） die "perl $0 <genome.fa> <weizhi.txt> <OUT> " unless(@ARGV==3 ); use Math::BigFl...

文章 exprs.MA函数提取MAList芯片红绿强度（表达量）

...挖掘、GEO芯片数据标准化、R语言画图 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据...

文章 circos-基因组圈图绘制软件基础绘图

...准备 参考上图，绘制需要两项基本内容，其一是染色体信息文件（核型文件），主要目的是在图片上显示出染色体，并进行颜色等相关设置；其二是标签文字文件（文本text文件），主要目的是在染色体上具体的位置将基因作为...

文章 iTOL对进化树添加外部标签

在画进化树，需要对标签添加一些信息时，可以使用iTOL对其添加外部标签。 例如当前进化树为： 准备好要添加信息的注释文件，如下： DATASET_TEXT#In text datasets, each ID is associated to text label, which can be displayed directly on the node br...

文章 挖掘公共基因大数据的时代已经到来

...33种癌症，11000多列病人的多个组学的数据以及临床表型信息。组学数据包括基因组的变异，转录组，miRNA, 甲基化，蛋白质组等。到目前为止，依靠这座数据金矿，已经发表的SCI论文就有4140篇，其中不乏大量CNS级别的论文。这座...

文章 R语言绘图之调色

...| 基因家族分析 | ceRNA | NCBI中的基因组数据 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 你不知道的微生物互作分析方法

...表示OTU在每个样品中的丰度。而最后一列是OTU的分类世系信息，涉及门纲目科属种等。OTU数据也可以只是具体到属水平的分类。 也可以准备环境因子数据进行联合分析，如下： 插件安装 Cyroscape的安装可以参考：Cyto...

问题 构建系统进化树时利用课程提供的脚本提取不出来cds序列是为何？

运行这个脚本后 没有出来结果  linux出来一个这个信息