问题 老师，构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch（e-20）搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么，不进行这一步可不可以

老师，构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch（e-20）搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么，不进行这一步可不可以

问题 请问在比较基因组学中,怎么区分由祖先染色体加倍还是物种分化后独自加倍而形成的同源基因？比如下面的玉米A和B基因组

问题 目前我感兴趣的植物基因(全基因组测序未完成），仅仅在NCBI上公布了mRNA序列，大概有80个。请问可以进行基因家族生物信息学分析吗？

问题 老师，在做基因结构时，脚本只能从GFF文件提出mRNA和CDS，做不出基因结构图，该如何解决，图中分别时GFF文件，脚本和提取的结果

问题 老师，在做蛋白互作网络图时，https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/这个网站并没有我研究的物种，那么我在上传文件时应该怎么办？

问题 基因家族用MEME工具预测motif时，序列有1500多个，结果中只显示了挖掘到的motif，却显示不了在每个基因上的位点图，怎么办？

问题 进行SNP注释的 table_annovar.pl 文件老师可否发我一份，在课程文件里没找到呀。微信、手机号13183373224 邮箱514551314@qq.com

问题 基因家族鉴定

请问老师。我要鉴定某个物种的胰凝乳蛋白酶。在PFAM上找到一个PF03761，来源于PFAM-B ，是胰凝乳蛋白酶的某一个家族（Chymotrypsin family Peptidase-S1），请问我利用这个pFAM号能够较全的鉴定出该物种的胰凝乳蛋白酶么？ 可信度高吗...

文章 cactus报错：Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus XML

报错： 运行cactus-pangenome的时候报错： [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus XML 问题出在 Cactus 配置文件中缺少 partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows 属性。这个属性...

问题 docker load -i /mnt/data/home/liangziyang/metagenomics-data/metagenomics-v1.2.tar.gz加载docker时提示no space left on device

老师，您好。我的系统是Ubuntu的，现在已经安装完成docker了，但是在加载我们自己的docker时，老是显示no space left on device，我之前问了AI，说是docker默认存储位置在我的根目录中，我根目录的硬盘剩余空间有40G，想问一下这是什...

问题 老师，我做泛基因家族鉴定时，06.SV_analysis最后得到的All.final.sv.out基因结构变异信息只有一条，请问哪里可能有问题

这个文件是空的 这个文件正常 这个文件没有变异类型，和教程示例不一样

问题 你好，我想问一下，为什么分染色体提取的序列有的能全部提取到，有的只能提取到一条？谢谢！老师您好，您看看这个输入文件，是不是有问题？谢谢

问题 最近用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错，看您留言说已经解决了，请问您是怎么解决的呢？望您解惑，谢谢。

问题 老师您好!请问在计算基因家族ka/ks时，是所有的重复基因对（包括串联重复，片度复制，同源基因）都要进行计算吗，还是仅计算串联重复基因对一种

问题 无全基因组物种基因家族鉴定，利用转录组及全长数据，发现看到别人发表同物种自己正在做的基因，但胁迫处理不同，我可以继续做吗？还是换题