5 基因家族鉴定

请问老师。我要鉴定某个物种的胰凝乳蛋白酶。在PFAM上找到一个PF03761,来源于PFAM-B ,是胰凝乳蛋白酶的某一个家族(Chymotrypsin family Peptidase-S1),请问我利用这个pFAM号能够较全的鉴定出该物种的胰凝乳蛋白酶么? 可信度高吗?

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最佳答案 2018-09-09 02:00

当然可以的,用这个号到pfam上下载对应的隐马尔科夫模型,用hmmsearch对该物种所有的基因的蛋白序列进行搜索,就可以得到该物种的所有具有这个结构域的基因;

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其它 1 个回答

易--刘

可以用,也可以用Ncbi的blast

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  • 夕阳无限好 提出于 2018-08-09 11:22

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