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文章 部分基础绘图函数隐藏坐标轴(并重绘)

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 混池(BSA)定位必看的10个知识点!

...性状数据做个类似如下的直方图: 然后结合直方图的信息,共同来选择样品,如上图所示,最左侧的两列和最右侧的两列适合取样。 Q5:子代群体规模不够,应该优先取极端还是优先取数量? A5:很多物种的子代群体很难做...

问题 泛基因家族-结构分析

...怎么改一下"s/_/\t/g"|这个命令啊。 #提取基因的位置坐标信息 cat ${svgene}_gene.list|sed "s/_/\t/g"|while read -r gene sp; do grep "$gene" ../01.data_prepare/$sp.longest_isoform.gff3 >> ${svgene}.gff3;done

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 低成本转录组跨种遗传进化分析

...。与传统的NCBI上下载的EST序列相比,转录组数据量大,信息更丰富,更能代表该种的遗传信息,分析结果更准确。文献: https://www.nature.com/articles/srep35634文献:https://www.mdpi.com/2223-7747/13/4/521 

问题 [名词解释] 分子连接?

...中各个骨架原子排列或连接的方式,它反映了分子结构的信息。分子连续性是研究分子结构和理化性质与生物活性之间定最关系(亦即构效关系或SAR)的一种方法。 2.实验技术文献中提及生物分子连接/探针分子连接。 3.ADC和生物...

问题 如何从重测序的原始数据中提取某个基因序列?

请问老师,手里有很多样本的重测序数据,想把某个基因的序列全部提取出来,是可以直接从比对文件中,按照染色体的位置提取?还是说可以根据基因ID进行提取呢?我知道vcf文件是不可以的,vcf文件里是SNP的信息

文章 微生物互作网络构建教程网站--Microbial association network construction tutorial

...操     微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

问题 利用非负矩阵对癌症分子进行分子分型

老师您好,我利用TCGA下载了某一癌症的read counts和clinical信息,首先分析出差异基因,然后想利用差异基因进行分子分型,非负矩阵的方法,遇到了困难,主要是对欸夫矩阵不理解,老师您能给讲解一下非负矩阵的用法吗

文章 字节跳动核心竞争力到底是什么?

...细介绍保证字节跳动公司核心竞争力的关键来源,分别是信息通畅、预设信任和模式集权。 1.1.信息通畅 字节跳动内部推崇”直入主题的提问、回答“,”不要包装结果,不要向上管理,投leader所好“,”鼓励群聊不要单聊...

文章 R使用ggtree包报错

报错信息:Error: package or namespace load failed for ‘ggtree’: object ‘get_aes_var’ is not exported by 'namespace:rvcheck' 原因是rvcheck版本过高,降级即可 remove.packages("rvcheck") install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rvcheck/rvcheck_0.1.8.tar....

文章 Cytoscape如何基于点的属性快速对点和相连的线进行颜色分类

...T5G19610 ath-miR156b-3p AT2G38440 ... ... 如涉及相关的属性信息,可以在数据中增加相应的列,来描述点或者线的特征。 基于最原始的数据可以获得如下图片(三角对应miRNA,圆点对应靶基因): 1、根据其他的分析,例如基...

文章 MENA如何结合OTU共现性网络与环境因子

...16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数...

问题 virtual box导入虚拟机报错VERR_ZIP_CORRUPT

报错信息如下,是怎么回事:

问题 请问在用SURVIVOR进行多样本SV合并出错

在用SURVIVOR进行多样本SV合并时,生成的合并vcf里只保留了两个样本的信息,命令如下SURVIVOR merge sample_files 1000 2 1 -1 -1 -1 group_merged.vcf,sample_file里包含manta和delly鉴定出来的SV