这是其中一个单样本信息,打开之后是这样的 这是我R语言下载得到的基因表达矩阵的一部分 问题:GEO下载下来的表达矩阵数据为什么有负值,能用吗,需要经过转换吗?
报错如下信息,一般是怎么解决呢? Exception in thread "main" java.lang.NullPointerExceptionat family_circle_plotter.paint(family_circle_plotter.java:197)at family_circle_plotter.main(family_circle_plotter.java:334)
报错信息 之前生成的文件
在转录组里筛选的某一个差异基因没有注释通路信息,要如何确定该基因在哪条kegg pathway上?在KEGG在线网页上根据基因ID号也没有查到所在通路。
...aryotype --format=pdf --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout 报错信息如下: markers', 'networkx.algorithms.community.__future__', 'networkx.generators.atlas', 'networkx.algorithms.connectivity.edge_kcomponents', 'pkg_resources._vendor.types', 'scipy.sparse._matrix_io', 'time', 'jcvi....
...出现外显子格式不正确或者是输出文件格式不正常等报错信息,snp.refGene.fa和snp.unknown_multianno.txt则是0KB
请问老师,我已经成功安装了HiC-Pro, -h会有帮助信息出来,但是运行HiC-Pro -c config-hicpro.txt -i rawdata/ -o results,缺没有任何提示自动停止了,生成了仅包含链接的rawdata和config文件的结果文件夹,请问应该如何成功运行这个软件
...基因组 参考基因组是指该物种已经破译的全基因组序列信息及注释文件,reads比对到参考基因组是数据分析的第一步,也是最重要的一步,其他所有分析内容都是基于reads比对结果分析的,如下图: 那么,reads比对是你所想的...
...征用来识别潜在的病毒。 利用sRNA分子特征来确定病毒信息 不同的产生途径中形成的病毒smallRNA(vsRNA) 具有不同的分子特征。基于这些分子特征(如:序列长度,碱基偏好性等)可以确定病毒与宿主相互作用的类型。由siRN...
老师您好,请问这个图的绘制信息在哪个文件,是06中的All.final.sv?下面的HP301就是对应的SUPP_VEC中的显示为1品系基因组吧。变异类型咋看是插入还是缺失呢?长度是两者之差?
...alysis ToolKit 的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的snp calling 软件之一。GATK 设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据,随着不断发展,现在也可以用于其他的物种,还支持CNV和SV变...
...推荐学习:R语言画图、R语言快速入门与提高 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...
...;宏基因组以IMG为参考;文件大小不超过15M; 其次是样本信息文件:制表符分隔;第一行必须以#SampleID起始;第一行全为列标题;第一列必须为SampleID;只允许使用字母、数字、下划线和连字符;不允许包含空格,逗号、引号、...
...L,并逐一下载原文献压缩成包,供大家参阅;此EXCEL包含信息如下:文献题目、期刊名称、影响因子、第一作者姓名、通讯作者姓名、发表时间、全文下载链接、一作单位名称,部分文献列表见下图: 从分析难度上看,掌握...
...绘图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...