GEO网站提供数据标准化结果负值

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这是其中一个单样本信息,打开之后是这样的

attachments-2019-02-KlwmJWFJ5c7390a832ec0.jpg这是我R语言下载得到的基因表达矩阵的一部分

问题:GEO下载下来的表达矩阵数据为什么有负值,能用吗,需要经过转换吗?
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2 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

这个是双通道芯片,不是单通道芯片,一个芯片对应的是两个样本,目前课程没有涉及双通道的差异分析内容,简单看看下面这个文章:判断GEO芯片数据是双通道还是单通道

https://www.omicsclass.com/article/687

目前这边还没有规范的差异分析方法

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 zxlll

因为我有已经想看的基因的表达,可以直接用下载得到的矩阵数据进行统计分析吗?负值的话需要怎么进行转化才能分析呢?

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