问题 顺势作用元件绘图时，图片有问题。基因id排列顺序乱

老师，我在用gsds绘制顺式作用元件时，如下图，有的线条隔行显示。我单独输入基因的bed文件显示正常，请问下这个要怎么调整

文章 IF=5 | 健康犬的肠道微生物组和代谢组对膳食纤维的反应

...在某些食物中，微生物群差异会引发代谢物的显著差异，显示出某些微生物群成员对特定膳食成分的代谢作用。食物成分对代谢物的影响最大，尤其是淀粉和不溶性纤维对代谢物相似性的决定作用最大，而对微生物群结构的影响...

文章 误差线该用标准差还是标准误？

...主要指示数据每一个数据点的误差（或不确定性）范围，显示潜在的误差或相对于系列中每一数据标志的不确定程度，以更准确的方式呈现数据【参考1】 Wikipedia 也对误差线（error bar，也称误差条、误差棒) 进行了说明，可以...

问题 meme中motif site和scanned site

我用meme分析motif时，部分蛋白在TBtool中显示没有motif，但网页版中motif location中显示motifsites➕scanned sites时可以看到比较矮的motif，那么怎么能在用TBtool做图时显示每个蛋白都有motif呢？

文章 python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

...i.graphics.karyotype seqids layout 结果图看这里 个性化设置显示颜色，最近做的一个基因组的共线性分析： 好了，到这里我们就结束了，想了解MCscan python版本的更多内容，可以查看MCscan 官网：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MC...

文章 安捷伦Agilent 外显子捕获试剂盒捕获区域bed文件下载

... Text files You can view the text files in any text editor program (e.g. NotePad) or spreadsheet program (e.g. Excel). [design ID]_Probes.txt - This file is a list of the probes in the design, with specific information about each probe, including its probe ID, sequence, genomic coordinates, and ...

文章 玉米遭受亚洲玉米螟为害时所诱导产生的直接和间接的防御反应及其生理生化和分子机制

...玉米螟为害后是否会产生对玉米螟的直接防御反应。结果显示：较对照，饲喂被危害过的玉米叶片2日龄玉米螟幼虫显现出较低的相对生长率（RGR）和较高的近似消化率（RCR），食物摄取转化率和食物消化转化率分别比对照低33% ...

文章 ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''

...所以我删除最后一条染色体，运行成功； 但是如果要显示不带数字的染色体，怎么办呢：可以手动修改染色体编号加上数字（mcscan_seqid），另外别忘了对应bed文件中的染色体编号也修改一下； 图片绘制出来之后可以用illustr...

问题 老师；我这儿GFF3文件格式和教学视频不一样；蛋白序列上显示gene_id有三个；我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析；GFF3文件上没有染色体位置信息，和教学视频的格式不同-gene出现在第3列；gene_id出现在第9列我该如何选取有效的ID呢？如何修改Perl脚本？如何能成功提取基因位置信息呢？望老师指点！谢谢呢

...师；我这儿GFF3文件格式和教学视频不一样；蛋白序列上显示gene_id有三个；我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析；GFF3文件上没有染色体位置信息，和教学视频的格式不同-gene出现在第3列；gene_id出现在第9列我该...

文章 基因家族分析后续试验怎么做？

...，选择的TCP基因具有高表达和具有相同的表达模式；结果显示TCP蛋白可能是通过彼此间形成同源或异源二聚体行使功能的。 9.  TaTCP9缺失突变四倍体小麦特性 在水稻中，OsTCP19基因是连接外界胁迫和生长发育的关键细胞信号...

问题 老师您好，问题是文中说到CPEB3 has a close positive correlation with cytotoxic cells, Th1 cells, and CD8 T cells（图a），为啥作者在正相关的一堆中提到了相关性不是最高的这三个，而在后面进一步分析中才提到TCM这中在图a中显示相关性最高的免疫细胞

问题 mcmctree运行报错"error: raise NGENE?"

老师好，我的工作文件夹是 10.time_tree_cds 日志文件显示："error: raise NGENE?" 但课程讲的mcmctree控制文件里并没有NGENE这个参数 —————————————— 输入文件如下： 序列文件 标定两个分化时间的树文件： 控制...

问题 使用MEGA构树时说是我的序列无效怎么办呀

使用两个种的蛋白序列用MEGA构树时，显示序列无效；检查了蛋白序列没有什么问题，序列最后的*字符已经删除；分别用每个种的蛋白序列试了试，显示还是序列无效

文章 使用evolview美化进化树

...列用，号隔开表示范围，空格之后为各种group分组圆环的显示方式：text为分组名称，fontcolor为字体颜色，linewidth圆环粗细，textorientation控制分组名称对齐样式。 2.6 进化树批量修改基因名字 有时候我们想批量重命名基因的...

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