mcmctree运行报错"error: raise NGENE?"

老师好,我的工作文件夹是 10.time_tree_cds

日志文件显示:"error: raise NGENE?"

但课程讲的mcmctree控制文件里并没有NGENE这个参数
attachments-2024-05-Srle457e66443dbbbf1eb.png

——————————————

输入文件如下:

序列文件

attachments-2024-05-BmZHVGzZ66443e04a24b0.png

标定两个分化时间的树文件:

attachments-2024-05-Ev0zW1rZ66443e242276a.png

控制文件:

(因为之前运行报错说 finetune已被弃用,便注释掉了这个参数)

attachments-2024-05-6JzryuUm66443e4d9df26.png

工作文件夹显示
attachments-2024-05-EmxPNLbR66444489bfb14.png

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

看看这个ndata这变量是否设置正确,和你的输入基因数量一致,打开mcmctree.ctl 文件看看的;

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string11

attachments-2024-05-DKTMvYil66457120ca397.png

attachments-2024-05-ZBREUSqP6645712ee0967.png

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  • string11 提出于 2024-05-15 12:49

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