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文章 SCI文章绘图及数据统计暑期班

...处理数据（求和，平均值，汇总等等）对数据进行转换，筛选，方便后续分析T检验，及可视化 超强的数据可视化能力：R语言绘图能力数据可视化，一定会给你的科研论文增色。 培训优势： 1.内容适中，时间充裕，学练结合...

文章 docker在windows系统和mac系统中安装

...个独立的密码，左侧的加速器帮助页面就会显示为你独立分配的加速地址。 对于使用 Windows 10 的系统，在系统右下角托盘 Docker 图标内右键菜单选择 Settings，打开配置窗口后左侧导航菜单选择 Daemon。在 Registrymirrors 一栏中填写...

问题 TCGA数据下载

TCGA数据下载时，像HNSC这种癌症，我只需要口腔鳞状细胞癌这个部分，数据下载的时候，不能够增加一个“primary site”这个参数进行筛选吗？不行的话要怎么改写R代码才能够完成这个目的，如果可以的话，为什么会报错呢？

问题 同源基因查找E值如何选择

请问查找同源基因家族的时候，E值取多大为宜？或者查找同源基因家族时有什么筛选依据吗？

问题 基因家族成员鉴定

...，请问如果能在蛋白网站上能找到的话还有必要用hmmsearch搜索吗？ 另外，用这58个序列做进化树，失败了，其中两个序列明显与其它不同（图中12和25号），请问我应该怎么筛掉呢（写到文章里）？我手动把E-value卡在0.00000001以...

问题 老师您好，我在用conet对自己数据分析时，总是报错。

我所用数据是在组学大讲堂课程中参考数据的基础上，把自己数据粘贴进去。随后按步骤操作时，软件conet总是报错，无法构建OTU网络图。报错图片我已上传，恳请老师相助。

文章 Rstuido相关快捷键

... Ctrl - Shift - C 取消注释或注释当前选定区域 Ctrl - f 查找搜索 Ctrl - d 删除行 Ctrl - s 保存 Ctrl - z 撤销 Ctrl - 1 将光标定位到代码编辑器 Ctrl - 2 将光标定位到控制台 Ctrl - 3 将焦点定位到帮助 Ctrl - 4 显示历史 Ctrl - 5 显示文...

问题 FileZilla Client出错

...持 FTP over TLS。 状态:服务器不支持非 ASCII 字符。 状态:已登录 状态:读取目录列表... 命令:PWD 响应:257 "/" is the current directory 命令:TYPE I 响应:200 Type set to I 命令:PASV 响应:227 Entering Passive Mode (130,14,29,30,195,87). 命令:MLSD 响应:5...

文章 NCBI高通量测序数据SRA数据库下载新方法

...址，不能直接用wget下载   所以通过在NCBI官网，直接在SRA搜索栏里输入paper的title关键词NIFTY BGI 搜索结果：   选一个文件点击进去  进去之后，再点击SRP 然后： 出现如下内容： 然后选择所有SRR文件： 下载Accession list之后得...

文章 GFF文件格式不标准，第三列只有GENE处理方法

先把gene 搜索替换成mRNA，再参考这里修改一下： 可以参考这里：https://www.omicsclass.com/article/816

文章 环境因子分析

...以将某些环境因子作为控制矩阵，计算微生物群落矩阵与剩余目标环境因子矩阵的相关性。即排除不关注的环境因子，研究关注的环境因子与微生物之间的关系。 ```{r} #otutable转换成bray 矩阵 otu_bray<-vegdist(otu, method="bray") ...

文章 mysql 查询select语句汇总

... select * from students where id = 1; -- 在students表中搜索id是1的。 select * from students where id >5 ; -- 在students表中查询id比5大的。 select * from students where name != "黄蓉"; -- 查询名字 不是黄蓉的信息。 ...

文章 计算lncRNA 与基因的表达相关性

...ead(lncRNA) lncRNA1 lncRNA2 lncRNA3 lncRNA4 lncRNA5 sam1 7.80 5.81 6.40 6.11 4.87 sam2 1.47 1.75 2.49 2.20 2.02 sam3 0.00 0.00 1.28 0.00 0.00 sam4 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 sam5 1.83 0.99 0.72 0.69 0.50 sam6 0.00 4....

文章 最新2区SCI思路解析—杨树TPS/TPP基因家族的系统分析

...报名 组学大讲堂是专业的生物信息培训机构，培训学员已超过35000人，仅基因家族分析实操班就已举办过16期，是国内该课程培训经验最丰富、最专业的机构。本课程有如下优势：① 课程针对0基础学员设计，边学边练，现场指...

问题 bio-linux中用hmmsearch遇到问题

用NB-ARC.hmm搜索拟南芥的蛋白质保守结构域时，运行显示fatal exception(source file fwdback.c, line 459)；foeward score is NaN。再次运行显示segmentation fault