想获得某个染色体序列,命令是啥?

因为我想根据基因在染色体上位置获得基因序列,但是发现有一个基因搜索不到序列。其它都可以搜到。

但是这个基因的CDS序列又能通过命令获得。

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rzx

根据输入的reg.bed文件内容提取对应固定区域(region)序列:seqtk subseq in.fa reg.bed > out.fa

准备bed文件:[基因所在染色体 基因起始位置 基因终止位置]

参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/2190

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