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文章 Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据-73种PBMC细胞的Marker

...大家分享一下最近刚发在Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据，数据量贼大，分析的也贼细致，如果咱们自己做的也是PBMC的数据，可以把它当作一个标杆进行参考。在单细胞方面本研究的核心内容可以概括为： 做了什...

文章 世界500强常用的管理方法和工具推荐

...规范化一体化，工具还可以帮助我们提升工作效率，专业管理人员必须要会使用工具。 下面给大家介绍九种高效率的处理工作的管理方法与管理工具，通过学习这些方法让你的工作变得有条不紊，可进可退，并且通过这些以...

文章 实验室linux生物信息服务器搭建CentOS7

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

文章 植物单细胞转录组文章

PBJ 烟草叶角单细胞转录组：Wang, L., J. Gao, C. Wang, et al. 2026. “Spatiotemporal Metabolome and Single-Nucleus Transcriptome Integration Illuminates an Auxin Gradient Orchestrated by NtTAC1 Underlying Leaf Angle Regulation in Tobacco.” Plant Biotechnology Journal1–19. https://d...

问题 单细胞测序数据进行细胞通讯分析

进行猪样本的单细胞测序数据进行细胞通讯分析时，cellphonedb method statistical_analysis meta.tsv normalize.data.tsv \   --counts-data hgnc_symbol   --iterations=100 --threads=1，这个代码里面 --counts-data hgnc_symbol 中的"hgnc_symbol"需要修改吗？改为什么...

文章 人胚胎性腺发育单细胞转录组，胚胎期

...小鼠（中位;n = 10,411）和外部猕猴（下：n = 2,685）中生殖细胞的 UMAP（统一流形近似与投影），这些数据集按生殖细胞状态、性别、供体/样本身份及发育阶段标注于受孕后周（PCW）或胚胎（E）/出生后（P）日）。去除双重体和低...

文章 镜像加速（Docker Toolbox）与挂载数据到到虚拟机

...执行【docker-machine stop default】命令停止default虚拟机 3、打开“Oracle VM VirtualBox”，点击 管理->虚拟介质管理 4、选中disk.vmdk，右键->复制 5、点击“下一步” 6、选中“VMDK”，下一步 7、设置副本的名称和地址，点...

问题 请问怎么把保守结构域和进化树画在一张图

有没有什么软件可以用

问题 单细胞细胞周期相关基因文件准备中遇到的问题

...文件的时候遇到以下几个问题： 1 我做的这个作物研究细胞周期的很少，我是把我这个作物的所有基因与拟南芥的所有基因进行比对，然后通过这个去找细胞周期的相关基因，这样是否合理？ 2然后我想准备一下细胞周期的基...

问题 保留注释信息中能编码蛋白的基因，结果文件是空的应该怎么办？

保留注释信息中能编码蛋白的基因，结果文件是空的应该怎么办？文件的路径和文件格式找不到问题。

文章 统计每个窗口内SNP变异位点数量

bedtools 软件可以统计每个窗口内SNP变异位点数量，具体命令如下： bedtools coverage -a window.bed -b raw.filtered.snp.vcf.gz  -counts >result.txt 其中bed文件格式如下： 结果文件如下： 最后一列为每个窗口内SNP数量。

文章 3分2区蛋白质组学文章怎么写？

...6319种蛋白可以定量，并进行了GO、KEGG、功能域预测、亚细胞定位等分析； 2、通过差异分析鉴定了116个差异蛋白DAPs，其中35个上调，81个下调； 3、对鉴定出来的所有蛋白进行GO分析和亚细胞定位分析； 4、对差异蛋白进行富...

文章 单细胞分析 质控 线粒体 红细胞 核糖体

过高的线粒体含量可能是因为细胞质RNA穿过细胞膜导致，或者在取样的过程中死亡细胞过多正常：心肌等耗能较多的地方，线粒体基因含量也可能会比较高 人：^MT- 小鼠：^mt- 检测是否存在血红蛋白污染 人：^HB[^PES] 小鼠：^...

文章 GeneDoc|绘制基因多序列比对图时对序列进行排序

打开GeneDoc软件，输入序列之后，序列顺序是输入文件中序列的顺序。如图： 这种情况下想使序列按照ID进行排序的话，应选择菜单栏中“Sequence List”选项，如图【S】： 在弹出界面选择<Sort Name>可以对基因序列进行排序。 ...

问题 R语言ggplot2 做气泡图

报错如下，我的表格里的Pvalue 值设置单元格格式为数值了，仍然不行，需要怎么设置这列数据的格式呢？