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文章 Uniprot蛋白数据库介绍及使用详解！

...息，整合了包括EBI（ European Bioinformatics Institute）、SIB（the Swiss Institute of Bioinformatics）、PIR（Protein Information Resource）三大数据库的资源。 EBI（ European Bioinformatics Institute）： 欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）是欧洲生命科学旗...

文章 群体遗传进化分析用MEGA

...分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！）。 第四步：other 除以上几个分析之外，MEGA还涉及其他很多种分析，例如核苷酸序列和蛋白质序列相互转换，在线blast等等，相关的使用说明可以在MEGA官方网站获得，目前MEGA版本已经...

文章 R语言“had non-zero exit status”安装报错

... 或者从本地安装： install.packages("path/package",repos = NULL, type="source") 当然，还有的情况需要换几个repos才能安装成功 这里推荐一个常用的repos repos='http://cran.rstudio.com/'install.packages('packages', repos='http://cran.rstudio.com/') 或者使用p...

文章 TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

...分析，比如lncRNA, mRNA， miRNA 等，而文章《identifying mirna and gene modules of colon cancer associated with pathological stage by weighted gene co-expression network analysis》则结合Gene,miRNA 分别进行WGCNA的分析，获得性状相关的Hub Gene和 Hub miRNA, 再基于miRNA...

文章 外源插入位置查找好方法

...o probe cell wall regulation in Cryptococcus neoformans. Fungal genetics and biology : FG & B. 2015;82:9-21. doi:10.1016/j.fgb.2015.06.003.

文章 怎样才能选到靠谱的抗体？挑选抗体的4大秘诀分享

... 标题：Gut-derived endotoxin stimulates factor VIII secretion from endothelial cells. Implications for hypercoagulability in cirrhosis 期刊：Journal of Hepatology IF：12.486 产品名称：RAB27A Polyclonal Antibody 产品货号：E-AB-60509 标题：The arginine methyltransferase CAR...

问题 duplicate_gene_classifier没有生成gene_type文件

duplicate_gene_classifier没有生成gene_type文件

文章 转录组后续实验怎么做？

...献：Characterization of the Asiatic Acid Glucosyltransferase, UGT73AH1, Involved in Asiaticoside Biosynthesis in Centella asiatica(L.) Urban. Int. J. Mol. Sci. 2017, 18, 2630    日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不...

问题 在学习基因组重测序过程中，执行变异结果统计与绘图展示的命令报错

执行命令：perl $scriptdir/vcf_stat.pl -vcf snp.unknown_multianno.vcf -type snp perl $scriptdir/vcf_stat.pl -vcf indel.unknown_multianno.vcf -type indel 报错：2024-03-26 10:56:32:    Rscript /work/my_reseq/scripts/barplot.r -i /work/my_reseq/5.var_ann/SNP_gene_ann.stat -o /work/my_reseq/5...

问题 duplicate_gene_classifier没有生成gene_type文件

老师您好：    我跑完duplicate_gene_classifier只显示了每个复制类型的统计信息，没有生成gene_type文件。请问要怎么解决。   

文章 linux命令之AWK

...上数字/[0-9][0-9]*/    一个或一个以上数字FILENAME 文件名OFS      输出字段分隔符， 默认也是空格，可以改为制表符等ORS        输出的记录分隔符，默认为换行符,即处理结果也是一行一行输出到屏幕-F'[:#/]'   定义三个分隔符...

问题 xpclr报错AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

...9, in load_vcf_wrapper     assert "samples" in callset.keys(), "None of the samples provided in {0!r} are found in {1!r}".format( AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

问题 WGCNA分析内存的问题

...因进行分析时，在计算TOM值时总出现“cannot allocate vector of size 1.6GB.”这是为什么呢？样品数和基因数变少却无法计算。（实验室服务器64位操作系统，16GBRAM）有什么解决方法么？

问题 GSEA基因表达数据文件报错

<Error Details> ---- Full Error Message ---- There were errors: ERROR(S) #:1 Parsing trouble edu.mit.broad.genome.parsers.Par ... ---- Stack Trace ---- # of exceptions: 1 ------Bad rowname - cant be empty at: 0 >

问题 无法链接到docker守护进程

docker 容器自动退出，再连就报错：Cannot connect to the Docker daemon at unix:///var/run/docker.sock. Is the docker daemon running? 我检查docker运行状态显示正在运行： docker.service - Docker Application Container Engine Loaded: loaded (/lib/systemd/system/docker.servic...