...2. 启动docker及下载扩增子镜像： docker search omicsclass #搜索omicsclass提供的docker镜像docker pull omicsclass/ampliseq-q1 #下载扩增子镜像docker images #检查是否下载完成 3. 在D盘下建立FAPROTAX文件夹，把准备好的三个文件放进去。 4...
...器设备; 2，不能检测未知的突变; 3，每次检测样本和位点数有一定要求。 所以，massarray法适用于有相关仪器的实验室，或者大量样本同时进行多位点分型检测，如果你的实验室没有相关仪器，或者处理不了大量样本怎么办呢? ...
...题：1.无参转录组中有unigene的pfam注释文件，能不能直接搜索我要找的基因家族来确定？是否还需要用hmmer对unigene的pep文件进行筛选？2.无参转录组筛选出的基因家族与基因组筛选出来的基因家族代表的意义是否一样？转录组筛选...
...一条桥，直接连入到网络中了。因此，它使得虚拟机能被分配到一个网络中独立的IP，所有网络功能完全和在网络中的真实机器一样。 虚拟机与主机关系： 可以相互访问，因为虚拟机在真实网络段中有独立IP，主机与虚拟机处...
...一行显示出来了，请问为什么会这样 #去除重复的hmmer搜索的转录本ID，多个转录本ID保留一个作为基因的代表，此步建议对脚本输出的文件手动筛选，挑选ID： perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt WRKY_domain_new_out_selected.txt W...
我做拟南芥的NBS基因家族分析时，最后经过hmm两次搜索一共获得192个基因，在SMRT中确认结构域的时候，最上面显示没有匹配的是10个，然后对下面出现结构域的基因一一检查，发现只有98个有该结构域，发表的文献中是165个左右...
...class.com/article/1100 另外一种就是通过NCBI主页的入口基因搜索下载。通常是不知道GEO编号，通过样品类型，实验处理，平台信息等搜索筛选想要的GEO数据：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，进入NCBI主页，搜索数据选择GEO DataSets，如果搜索...
已解决
...据的工具，常用于敏捷软件开发中，如Scrum。它可以呈现剩余工作量和可用剩余时间，并通过可视化的图示表述繁复文字无法表述的意思。 一、燃尽图是什么？ 燃尽图可以呈现团队处理用户故事进度，是一种对工作完成情况可...
RStudio跑代码时报错，出现“无法分配大小为7.4 Mb的矢量”，释放内存等方法都试过了，如何解决
...芥当中与重金属响应相关的关键基因。 2.关键差异基因筛选分析 分别对这11组数据用limma包做差异表达分析，筛选条件为：corrected P-value < 0.05 and |log2FC| > 1。11组数据筛选了很多差异基因，这里就不再赘述分别是多少了。 ...
...参数 （1）-l 资源：指定作业执行要求的资源，如使用节点数、CPU数量、内存大小等。 （2）-N 作业名称：指定作业的名称，方便管理和查找。 （3）-o 输出文件：指定标准输出文件的名称。 （4）-e 错误文件：指定标准错误输...
老师，我在做hummer搜索时，输入hmmsearch --domtblout ACTS_hmm_out.txt --cut_tc WRKY.hmm proteins.fasta后，出来的结果E-value值最大是3e-10，而讲课的时候分析的拟南芥WRKY的E-value值是选取的小于0.001，我这个出来的结果最小都3e-10，怎么设置能让...