...的的扩张。 3. 苦荞中FtMAPKs染色体定位染色体作图分析显示,16个FtMAPK基因存在于除6号染色体外的所有染色体上。 4. 苦荞FtMAPKs基因结构及Motif分析分析了16个FtMAPKs的基因结构和Motif,绘图如下: 5. 苦荞FtMAPKs顺式作用元件...
新:Species_ORFs_heatmap.R Perl_result5_revise 旧: Perl_result5_revise genus_ORFs_heatmap.R
...eqids 文件,该文件规定图中各基因组的染色体顺序和需要显示的染色体,一行代表一个基因组,其顺序要与layout中基因组顺序一致。这里只需在文件最后加入可可基因组的染色体名称。修改后文件如下: chr1,chr2,chr3,chr4,chr5,chr6,c...
...阵的信息构建差异比较矩阵(cont.matrix),由差异比较矩阵显示结果可知,是进行INFECTED 与CONTROL之间的差异分析。 >cont.matrix = makeContrasts(INFECTED-CONTROL, levels=design) > cont.matrix ContrastsLevels INFECTED - CONTROL CONT...
run_pipeline.pl -Xmx30G -SortGenotypeFilePlugin -inputFile clean.vcf.gz \ -outputFile clean.sorted.vcf.gz -fileType VCF
...出自己想要的复杂公式,那么就得知道,公式表示方法和显示结果的对应关系。这里有段代码可以产生对应关系,需要输入文件:math.txt ex <- parse("math.txt") labs <- readLines("math.txt") n <- length(ex) par(mar = rep(0.1, 4), cex = 0.8) plot...
我的TBtools版本显示的是v0.665,version显示的是最新,可是找不到amazing super circos这一项,只有amazing simple circos
...取食后不同时间点的TPS基因表达数据。差异表达分析结果显示,部分 TPS 基因在亚洲玉米螟取食后表达上调,随着取食时间的延长,差异表达的 TPS 数量增加,上述结果表明TPS 基因家族在玉米对于玉米螟的取食响应中起着重要作...
... 阈值 0-1,可指定过滤阈值 三、结果 运行成功会有如下显示:分别是标准化的OTUtable、阈值图片,每种表型预测的具体OTU、每种表型预测相对丰度图、统计表。 参考文章 doi:https://doi.org/10.1101/133462 此外,我们在网易云课堂...
...的对照细胞系MC3T3-Cont。mc3t3drorβ细胞系的克隆和序列分析显示,小鼠Rorβ等位基因存在1碱基对(bp)和4-bp缺失,导致移码突变,最终导致无功能等位基因。为了分析Rorβ缺失对成骨细胞基因表达的影响,从成骨培养基中培养的MC3T...
水稻转录组数据绘制KEGG通路,显示 按照如下格式输入:(查找物种时,网页始终无法显示,水稻选osa不知道对不对,或者gene ID有问题)
用课程测试的数据运行admixture的时候,显示segmentation fault. 因为docker镜像omicsclass/reseq里面没有找到admixture,所以用conda install另外安装了admixture。我用docker其他镜像的admixture,也是不行,还是显示segmentation fault。
按照教程进行,共享文件夹创建成功了,但是把拟南芥的fa文件复制进去之后我在power shell里用ll指令没有找到拟南芥的fa文件,请问这是怎么回事?使用ls指令也是只有显示文件夹不显示文件
...交集的大小及分布。 1.Upset 图的结构 主交集柱状图:显示每种交集的大小。 X 轴:表示集合交集组合。Y 轴:表示对应交集的大小(元素数量)。 集合连接点图:在柱状图下方显示交集涉及的集合。 用点连接线标识参与交...