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...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...
我现在打算做大基因家族里面的几个小家族，小家族没有pfam号，结构域也是整个大家族共有的，现在用blastall（e-5，没筛比对率）找到了三百多个基因，去查大家族的结构域，最终筛到两百多个。但我查了一下在有研究过的物种...
输入的数据格式是gtf格式的拟南芥转录本数据 在other feature数据框输入的数据如下（自己编写的测试数据） AT1G109203 1500 2000 F1 AT1G109203 2000 2500 F2 AT1G109203 2500 3000 F3 AT1G109203 3000 3500 F4 AT1G109204 3500 4000 F4 AT1G109204 4000 4500 F5 AT1G109...
...20 -seqids yes > ref.fa.harvest.scn 3. LTR_HARVEST_parallel 的下载和使用 git clone https://github.com/wild-joker/LTR_HARVEST_parallelLTR_HARVEST_parallel/LTR_HARVEST_parallel -seq 基因组 -threads 线程 -gt GenomeTools所在位置 参考： ltrharvest.pdf (genometools.org) ...
以上 2 张图片是我在网上搜索得到的关于 QTL-seq 原理。但是为什么诱变得到的材料，就不能够用 QTL-seq 来分析？ 我说获得的 EMS 诱变材料已经是自交 M7 代的材料了，也不能用 QTL-seq 来分析么？因为 Mutmap 方法需要自交，所以感...
... 由 kkgithub.com 提供的免费的 GitHub 公益加速项目，仅需在 github.com 的 g 前加上 kk，就可正常访问 GitHub。 任意 github 的项目，如无法使用大概率使用的是国外 IP 访问，请使用国内 ip 访问。 如：github.com/XIU2/UserScript 将链接更...
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之前在某一物种中做了无参转录组。 想分析该物种中某一家族基因，并用其与其他基因组清晰物种的同家族基因进行进化分析，可以把核苷酸序列翻译为蛋白序列后比对吗？需要注意什么？ 虽然无参转录组可能得到的在该物...
...命令的方式，但是两者有较大的不同。 总体概括一下，在perl程序中“`$cmd`” 获取的是程序执行结果，而system（$cmd）获取的是程序执行后的返回值。 详情参看如下示例： demo示例： #!/usr/bin/perl use strict;my ($cmd,$ret1,$ret2);$cm...
我们在做数据分析时，经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况，为了方便后续的数据分析，需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称转换方法1、打开uniprot网站，...
Rocks的管理维护 1.添加节点 如果要向cluster添加节点，在主节点上使用 insert-ethers 然后在子节点设定网络启动。实现自动化安装。 2.添加用户 用一般的添加用户的命令进行操作。 adduser username passwd username rocks sync users 特...
...，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程6. 生物信息入门到...
...胞亚群分析 4.细胞通讯分析 同样的套路 MDK- NCL在肺癌中又发：https://www.frontiersin.org/journals/immunology/articles/10.3389/fimmu.2025.1546382/full