...组装的这个物种的基因组大小为 400 Mb，一共12条染色体，在 划分GROUP的时候，其中第一条GROUP很长，有 395 Mb，其余都很小。如下： 1. sample.clean.counts_GATC.12g1 394863216 2. sample.clean.counts_GATC.12g10 160144 ...
...VADRMDNNANVAYGVAFERVCIVQRQKIAY LGGKGPFFYNLQEVRRWLEKNFSKRUKLD 这个问题怎么解决？ 并且不只一个序列也不只一个基因组有这种情况
...习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入...
...ers. 这是因为网站贴图片需要上传，你会发现有两个图片在页面中，删除上面那个图片再提交，就不会有问题了如下 The content may not be greater than 65535 characters.
...host_del_and_qc.sh中fastp质控后，bowtie2去宿主的代码进行质控和去宿主的操作是没问题的吧
老师，请问一下我docker安装成功，怎么无法search镜像
老师您好！ 我在使用HMM模型搜索目标蛋白时，遇到一点问题。我所做的植物是无花果，目前只有基因组序列文件，还没有蛋白序列、CDS序列文件。 实验室有转录组的数据，请问我是否可以基于转录组数据，来找目标基因呢？HM...
...变体，hg19与hg38的5UTR的注释位置有差异。我想为什么会存在差异。②真核基因组5UTR的位置是不是都通过算法预测加上RNA重新反推的还是有的是预测的没有实验验证?③老师我研究启动子，启动子一般在TSS上游1-2k内，但是在2004年...
请问老师在上课做26个玉米基因组的基因家族成员鉴定等分析时，用的是docker run -it -m 3G -v/home/us132/pan-gene-family:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v1.0镜像，而做泛基因集列表时用的是docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v ...
在前面的文章中，我们介绍了如何从TCGA中下载数据，但是那种方法下载的数据中包括了癌症相关各种类型的样本，而有时候我们只想分析其中的一种样本的数据，那该如何下载指定类型的数据呢？ 其实可以用TCGAbiolinks 软件包...
我在用snpeff进行snp注释的时候，已经将snpeff.log文件中data.dir的值由"./data"改为"."，在最后一行添加自己基因组的信息：ath.chr1.genome=。。出现不能读取或者不能genes文件的错误，不能够建库生成snpEffectPredictor.bin文件，请问是除了什...
...用时不能有NA/NaN/Inf(arg11) 出现此类错误多数情况是数据在绘图过程中进行处理后 出现NA/NaN/Inf导致无法进行聚类。 其一是原数据中本身存在NA等情况，其二是原数据存在数据完全无变化，但pheatmap()函数中却选择了scale参数进行...
在vcf转phy时报这个是什么原因呀，vcf文件要以dash开头？
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...
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