我在用snpeff进行snp注释的时候,发现出现如下错误java.lang.RuntimeException: Error reading file '/home

我在用snpeff进行snp注释的时候,已经将snpeff.log文件中data.dir的值由"./data"改为".",在最后一行添加自己基因组的信息:ath.chr1.genome=。。出现不能读取或者不能genes文件的错误,不能够建库生成snpEffectPredictor.bin文件,请问是除了什么问题

attachments-2020-05-zAkBZ5XA5ecb9188421b4.png

attachments-2020-05-gNmMKulc5ecb91f67b58e.png

请先 登录 后评论

2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

没用过snpEFF,我们都用ANNOVAR注释基因组;

请先 登录 后评论
Chen Qing

请问楼主问题解决了吗?我也遇到了同样的问题

请先 登录 后评论
  • 2 关注
  • 0 收藏,2451 浏览
  • 杨辉 提出于 2020-05-25 17:39