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文章 exFAT格式的硬盘挂载问题

...式,这里是exfat 那如何挂载?最简单的就是用 umask、uid 和 gid 选项来控制文件权限 sudo mount -t exfat -o uid=$(id -u),gid=$(id -g),umask=000 /dev/sdb2 /export/data2 uid=$(id -u):将当前用户设置为挂载设备的所有者。 gid=$(id -g):将当前用户组设...

问题 circos问题

MADS.txt中的基因数是94,为什么显示的图里只有41

问题 老师,请问串联重复基因由cds blast得到,而共线性分析由mcscan比对pep序列得到,请问一下这两什么区别,为什么共线性分析我的基因家族(180基因)只有一半染色体有共线性,是不是哪里分析出错了

mcscan分析蛋白序列得到circose blast得到串联重复基因

文章 perl 多线程

1、并行系列一 线程是一单一的执行流程,它是所有程序执行过程中最小的控制单位,即能被 CPU 所调度的最小任务单元。线程与进程之间既有联系,又完全不同。简单地说,一线程必然属于某一进程,而一进程包含...

文章 简单的蛋白质组实验怎么炼成4分文章

...象是弓形虫(Toxoplasma gondii),研究者选取了弓形虫的三发育时期的样品:T-速殖子(tachyzoite)、C-包囊期(bradyzoites-containing cyst)以及O-卵囊期(sporulated oocyst),每时期两生物学重复。 02/研究方法 本文没有高深的实...

问题 老师您好,我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛基因编号文件和泛基因列表一样,不知道为什么

...n-genes.list文件大小一模一样,不知道是为什么?我现在有变动是,获得的泛基因列表中,C01基因组名称写的是C1,这可能是之前提取蛋白时候它自动命名省去了,但是一基因组(同样,还有C2-C9,L1-L9,Q1-Q9)。基因家族列表中...

问题 SNPcalling的方式有samtools结合bcftools,或者bcftools,或者gatk,三者之间有什么区别,那种方式更好一些

文章 实验室linux生物信息服务器搭建CentOS7

...等)与普通电脑上的硬件还是有区别的:也就是要求性能更好更稳定,自然价格也就更贵一些。例如,一块普通的4T硬盘与一块4T的服务器硬盘价格就相差3倍以上: 由于服务器24小时开机且高强度不间断运行,硬件一旦崩溃,...

文章 软件fastsimcoal2输入文件说明

...用Fastsimcoal2.7利用SFS模拟种群动态历史,一般是使用第二功能,需要三输入文件,这三文件的前缀必须相同: .tpl 模版文件(参数文件):用来指定历史事件、migration、样本大小、突变率重组率等等。注意,这里的突变...

文章 启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库!

...的上游。 2. 转录组起始点(TSS):是指与新生RNA链第一核苷酸相对应的DNA链上的碱基,通常为一嘌呤(A 或G),即5’UTR的上游第一碱基;注意转录起始点和起始密码子的区别。 3. 起始密码子和终止密码子:mRNA的开放阅...

问题 基因家族鉴定

老师好,我问一下:假如原始序列有5结构域,我鉴定出来的有4结构域,这序列还要不要保留?

问题 老师你好,请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量我有几不同浓度胁迫下的转录组数据,想利用此数据分析一下某基因家族,请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量?依据表达量画差异表达图?

文章 文本种单列数据频数统计

...计文本种各类型数据频数情况。 譬如有如下数据: ABVAGCGDEFDGRDFGAF 进行排序 sort 之后 uniq -c 即可统计各字符出现的频数 cat test.txt |sort|uniq -c      3 A      1 B      1 C      2 D      1 DF      1 E      2 F      4...

文章 农艺性状表型数据与环境关联互作分析R代码

local({r <- getOption("repos")  r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"   options(repos=r)}) options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")#install.packages("GGEBiplots")#install.packages("GGEBiplotGUI")library(GGEBiplotGUI)library("GGEBiplots")l...

问题 motif展示

老师您好,我想问问做motif分析的时候,结果里把1结构域给分成2motif呈现,这种问题该怎么解决呢?