利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载，不过，有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错，可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中： 矩阵文件的基本命名格式：GSEXXXXX_series_matrix.txt.gz 为...
老师您好，请问如果想合并同平台的两个数据集，GSE1只有我需要的疾病组数据，GSE2只有我需要的对照组数据，这种情况可以合并么？
...www.omicsclass.com/article/397），图片中可以直接显示基因位置数据，此外还可以转换成标尺的形式显示位置： 设置初始图片后，选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置成 Ruler at page margin 结果： 推荐课程： 基因家族分...
.../smart.embl.de/）是我们常用来进行domain搜索和蛋白质注释的数据库，它集成了很多蛋白结构预测和功能分析的工具，比如可以预测蛋白的一些二级结构：跨膜区（Transmembrane segments）、复合螺旋区（coiled coil regions）、信号肽（Signal ...
前面我们介绍了TCGAbiolinks下载数据，这里详细介绍一下如何下载临床数据： TCGA中三种临床数据类型： TCGAbiolinks中临床数据有以下三种类型，以及他们的区别如下： In GDC database the clinical data can be retrieved from different sources: ...
安老师，您好，最近准备用服务器分析微生物数据，购买了宏基因组和16s课件，在学习docker从ENA数据库下载fasq数据时遇到困难，ascp -QT -I 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasq.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR180/069/SRR18...
clinvar是一个开放的数据库，每个研究机构都可以向其提交数据，对于提交的信息，会有专家团队进行审核评级。对于数据库中的位点，根据注释信息的可靠性，分成了1到4个不同的星级，星级越高，可信度越高。 数据库地址...
请问练习数据上传是把RAW data文件夹上传 还是里面的数据单个都上传？
...次重复，用以检测该处理对水稻产量的影响。具体操作：数据--数据分析--方差分析：单因素方差分析--确定。 1选中目标数据，点击工具栏中“数据”选项。 相关概念解释：方差分析中，所要检验的对象称为因素（factor），...
不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件，后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt？
想要下载结肠癌的数据，原发位点为colon，按照老师的代码，报错，求老师指导 本想在老师帖子下边回复，可是评论不能分段，挤在一起太乱了。 以下是按老师代码简单改了改 resp = cases() %>% filter(~ project.project_id=='TCGA-COAD'...
...2场超实用的直播小课-《让AI帮你绘图》和《让AI帮你处理数据》（限时优惠仅需0.99元），课程围绕 AI等人工智能在多组学数据分析中的强大应用展开，帮你轻松搞定多个重要的组学数据分析及绘图可视化！仅需说话就能处理数...
利用limma 包进行芯片数据差异分析，需要按照分组信息构建分组矩阵，基于model.matrix函数完成，获得的分组矩阵结构类似下方显示结果： > design A BGSM1626001 1 0GSM1626002 1 0GSM1626003 1 0GSM1626010 0 1GSM1626011 0 1...