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文章 漫威英雄人物的基因改造,离我们还远吗?

...发关于基因编辑的文章,还是有可能的! crispr/cas9文库筛选服务—高分论文利器! 巴菲尔crispr/cas9文库筛选服务可以完成精准sgRNA序列的设计并精确人工合成,在基因敲除成功后,对测序结果进行基因表达谱分析、染色体DNA拷贝...

问题 老师,我要分析几个品种的基因表达量数据,在公共数据库大部分只有叶片组织的播种24天及以后的数据,我都选取播种24天的数据进行转录组分析可以么,另外我想以其中一个品种作为参考基因组,我是不是需要把这个基因组的fasta文件和gff文件建立索引,然后再分析这几个基因组的rnaseq数据,包括参考基因组的ranseq

文章 Mapchart 添加标尺

...www.omicsclass.com/article/397),图片中可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置: 设置初始图片后,选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置成 Ruler at page margin 结果: 推荐课程: 基因家族分...

文章 如何批量分析蛋白序列domain-SMART数据

.../smart.embl.de/)是我们常用来进行domain搜索和蛋白质注释的数据库,它集成了很多蛋白结构预测和功能分析的工具,比如可以预测蛋白的一些二级结构:跨膜区(Transmembrane segments)、复合螺旋区(coiled coil regions)、信号肽(Signal ...

问题 docker从ENA数据库下载fasq数据时遇到困难

安老师,您好,最近准备用服务器分析微生物数据,购买了宏基因组和16s课件,在学习docker从ENA数据库下载fasq数据时遇到困难,ascp -QT -I 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasq.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR180/069/SRR18...

问题 练习数据上传

请问练习数据上传是把RAW data文件夹上传 还是里面的数据单个都上传?

文章 TCGA临床数据下载—TCGAbiolinks

前面我们介绍了TCGAbiolinks下载数据,这里详细介绍一下如何下载临床数据: TCGA中三种临床数据类型: TCGAbiolinks中临床数据有以下三种类型,以及他们的区别如下: In GDC database the clinical data can be retrieved from different sources: ...

文章 clinvar数据库人类疾病数据库ANNOVAR数据库使用

clinvar是一个开放的数据库,每个研究机构都可以向其提交数据,对于提交的信息,会有专家团队进行审核评级。对于数据库中的位点,根据注释信息的可靠性,分成了1到4个不同的星级,星级越高,可信度越高。 数据库地址...

文章 宏基因组结果解读和个性化分析课程上架

...微生物群落与环境、宿主间的关系(如肠道菌群与健康)数据表解读:物种丰度表(OTU/ASV表)结构、功能信息表(GO、KEGG)的组成与应用 第二节:Venn和UpSet图 课程目标:掌握绘制Venn图和UpSet图,展示物种或功能的分布与重叠...

问题 老师您好,我在用conet对自己数据分析时,总是报错,具体数据格式有什么要求吗

文章 老师您好,请问在群体遗传进化中,模板数据黄瓜的分组,sample 是指的什么?是测序数据下机的样品编号?

不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件,后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt?

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...次重复,用以检测该处理对水稻产量的影响。具体操作:数据--数据分析--方差分析:单因素方差分析--确定。 1选中目标数据,点击工具栏中“数据”选项。 相关概念解释:方差分析中,所要检验的对象称为因素(factor),...

问题 TCGA数据中primary site数据下载报错

想要下载结肠癌的数据,原发位点为colon,按照老师的代码,报错,求老师指导 本想在老师帖子下边回复,可是评论不能分段,挤在一起太乱了。 以下是按老师代码简单改了改 resp = cases() %>% filter(~ project.project_id=='TCGA-COAD'...

文章 让AI帮你处理数据,绘制图表!让你强到可怕!

...2场超实用的直播小课-《让AI帮你绘图》和《让AI帮你处理数据》(限时优惠仅需0.99元),课程围绕 AI等人工智能在多组学数据分析中的强大应用展开,帮你轻松搞定多个重要的组学数据分析及绘图可视化!仅需说话就能处理数...

文章 芯片差异分析分组矩阵

利用limma 包进行芯片数据差异分析,需要按照分组信息构建分组矩阵,基于model.matrix函数完成,获得的分组矩阵结构类似下方显示结果: > design           A BGSM1626001 1 0GSM1626002 1 0GSM1626003 1 0GSM1626010 0 1GSM1626011 0 1...