...，会出现多个预测的ORF结构，然后我将该基因的蛋白序列和其ORF对应的蛋白序列比对发现只有一个预测的ORF其对应的蛋白序列包括该基因的蛋白序列。那么是不是可以用该ORF长度作为该基因的长度？先谢过老师！
和直接绘图使用per函数调整mar不同，cmplot包里自带了mer参数以调整四周空白区域的大小 用法类似 mar <- c(2, 2, 2, 8)CMplot( snp, plot.type = "d", bin.size = opt$binsize, chr.den.col = color, main = opt$main, file.name = opt$name, file = "jpg", file.outpu...
...以对不同物种的氨基酸序列进行注释分析。如果要对蛋白在pathway上进行可视化标注，那就需要下载pathway想的注释文件。主要有3类： 1. KGML 文件： 这个文件是对pathway 进行定义的文件，修改该文件就可以对代谢通路进行改变，...
...MdoScaf049s0015），但是进行共线性分析时，发现有两个成员和未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015）的成员是大片段复制基因对（MdoChr03g1975:MdoScaf049s0015 MdoChr11g0239:MdoScaf049s0015 ）。由于不知道未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015）的...
... 但是，我现在想使用你们推荐的docker（主要为了调整CPU和内存）。 运行 docker run -it -m 20G --cpus 4 --rm -v D:/ampliseq:/work omicsclass/ampliseq:v2.0报错。
treemix，按照课程中，一步一步操作，cat w.sh，提示没有这个文件。 该怎么处理
老师您好!我想问下单细胞测序数据如何将rds文件和pbmc.metadata.tsv文件中的某列信息给替换成其它信息？麻烦老师解答，谢谢
...ource venv/bin/activate # 激活完之后，虚拟环境的名称会出现在提示符的前面，用于标记当前的虚拟环境 (venv)$ # 此时查看Python的路径，会发现Python的路径就在虚拟环境下面了，而不是系统的那个Python版本 (venv)$ which python /Users/zhangqi...
老师您好！请问三代全长转录组测序中，鉴定新的转录本时，是将flnc序列和参考基因组比对，还是用抛光合并之后的得到的高质量的转录本序列与基因组序列进行比对
F2代人工群体的家系记录主要用来计算亲缘关系、群体结构和PCA，但是进行关联分析的时候还是仅用个体ID后面接性状就好了是嘛？表型性状是否需要符合正态分布？
第二行跑了几秒钟，就自动出现这个killed，应该怎么弄？
黄老师，用TBtools软件将进化树，基因结构和motif进行一张图显示时，出现图片这样结果，请问那里出现错误？
对分支颜色修改以及拖拽数据进去时都会出现右上角红框所示，无法保存修改的东西，拖入数据显示无法找到对应ID,自己的数据和实例数据都是如此，希望高手解答，谢谢。
老师，您好，运行 structure_plot.r -d ./ -s admixture.nosex的时候，提示bash: structure_plot.r: command not found 这是怎么回事呢？ 用的是这个镜像：
我的GFF文件是这样的： 运行perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt得到的文件是这样的： 请问怎么处理啊，老师？