问题 比较基因组共线性分析

老师，我做拟南芥和苜蓿之间我的基因的协同性分析，拟南芥中有3个，苜蓿中有七个，协同性分析结果只有一条基因配上了， 水稻里面也是三个，一个都没配上，请问正常吗？

问题 BSA实验到底怎么取样比较好？

近期想做个BSA实验，子代混池规模是50+50，导师让我每个子代提取一份DNA，然后混合成一个池测序，可是公司不愿意这么干，我想问下，这个是必须的吗？

问题 TCGA的甲基化差异分析只分析配对样本，还是比较所有正常样本和肿瘤样本？

问一下为什么很多文献中TCGA的甲基化只分析配对样本，而不是比较所有正常样本和肿瘤样本？

文章 Perl数组排序--sort()函数

...ASCII码表排序，所有的大写字母都排在小写字母前边。 比较函数 Perl的sort的工作方式是这样的，它遍历原始数组的每两个元素；每次把左边的值放入变量$a，把右边的值放入变量$b。 然后调用比较函数。如果$a的内容应该在左边...

问题 比较基因组共线性作图疑问

老师我在学习了咱们课程后可以做出两个物种的共线性图，但是我在看文献都是这种多个物种放在一起的图，我自己琢磨不明白是怎么做的，希望老师帮我解答

文章 Bioconductor安装软件比较慢

在采用Bioconductor安装一些软件包的时候，经常遇到下载速度较慢，容易中断等情况。  针对这个问题，可以采用国内的Bioconductor 镜像加速来解决。 我们采用清华大学的开源镜像。 使用方法如下： source("http://bioconductor.org/biocL...

文章 微生物组间差异分析之LEfSe

...图片。 前两步的Kruskal-Wallis秩和检验、Wilcoxon秩和检验 比较简单，类似T检验或者方差检验等，只不过T检验和方差分析为参数检验（要求数据符合方差齐性、正态分布），而在微生物多样性分析中，样品物种丰度分布不确定，...

问题 比较基因组学NCBI数据提取CDS失败

好像就只有最后一步没提取出来，我不知道什么原因，请老师解答

问题 在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与性状之间的关联特别小，不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理？谢谢~

abline(h = 1000000, col = "red") minModuleSize = 80 MEDissThres = 0.35

文章 SCI文章绘图及数据统计暑期班

....收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解 3. 如何下载基因组及查找基因 4. CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清 5. qRT-PCR相对定量计算详解 6. 绘一棵超酷炫的系统发育树！ 7. 100+篇2019年基因家族分析SCI（1-3月发表）免...

问题 根际微生物多样性，根部取样怎么取比较科学？

问题 比较基因组学使用MCscanX报错，请老师抽空解答一下。

问题 纯生信无实验验证的基因家族文章，比较推荐下面期刊的哪一个？

想问一下，Genes、scientific reports、plos one、Horticulturae、Protoplasma、Frontiers in Genetics期刊，纯生信无实验验证的基因家族文章比较推荐投这六个期刊中的哪一个？投哪一个可以不用补实验，更容易中？

问题 纯生信的基因家族文章，比较推荐投什么期刊?

纯生信的基因家族文章是不是不太好投啊，要投的话有什么推荐的期刊吗？

文章 ROC曲线的含义

...。 在《TCGA-生存分析》课程中，我们就是采用多因素COX回归构建一个Risk Score ,基于Risk Score 值的划分边界不同，可以筛选出最优的预测模型。