...差异表达分子太多，还是无从下手，需要从中再进一步的筛选，筛选出关键的分子或关键的相互作用关系。有一种筛选分子间相互作用关系的方法，那就是WGCNA。 WGCNA能将基因和相关的lncRNA 进行共表达聚类，聚类在一起的基因和...
...B 细胞。将骨髓瘤细胞与B细胞融合，形成杂交瘤细胞，并筛选产生抗原特异性IgG的阳性克隆。 ②从该克隆中分离编码小鼠VH和VL的DNA序列，并且从人细胞中分离编码人免疫球蛋白恒定区的DNA序列。通过基因工程构建小鼠/人嵌合...
...据:GSE84465, 其中4个GBM样本共3589个单细胞表达数据，作者筛选其中的2343个来源于肿瘤核心部位的细胞进行分析。分析用到的R包为Seurat 。经过质控及标准化数据，194个低质量细胞被过滤掉）.总共纳入19752个基因分析，方差分析找...
...通路分析，构建miRNA-gene 调控网络 分析结果 数据下载和筛选从TCGA数据库中下载并筛选基因表达数据和miRNA表达数据，其中基因表达数据中包含450个癌症组织和41个正常组织样本，而miRNA表达数据中包含455个癌症组织，8个正常组...
...或轻链，另一条链与一个随机化的互补链进行组合，从中筛选更高活性的突变株。通过固定抗体两条链中的一条链，对另一条链构建具有足够多样性的置换文库，随机组合有可能产生最佳链组合，经过噬菌体抗体库筛选可获得高...
今天为大家介绍一个有名的搜索蛋白互作网络的数据库：STRING。教大家如何制作一个蛋白互作网络 STRING数据库介绍： nString数据库是一个搜索已知蛋白质之间和预测蛋白质之间相互作用的数据库，该数据库可应用于2031个物种，...
...node id 是不需要生成的，iTOL在导入nwk文件时会为每个节点分配一个Node id。例如我用的nwk文件如下： 生成进化树后，可以查看每个节点都会有一个Node ID： 这样，我们就可以知道每个节点的ID了。
经常有同学询问如何筛选差异的基因（蛋白）。已经计算了表达量和p value值，差异的基因（蛋白）太多了，如何筛选。其中最为关键的是需要对p value进行校正。 基本概念： 零假设：在随机条件下的分布。p值：在零假设下，...
...gdc-client软件下载数据，需要以下三步才能完成： 1、GDC筛选检索下载需要数据的Manifest文件 TCGA改版后，下载方式变得大为不同，数据都整合在GDC（Genomic Data Commons）的DATA PORTAL中，网址：https://portal.gdc.cancer.gov/ 建议大家先从E...
...建立然后进行blast，然而得到结果是m8格式，不是hmmsearch搜索的结果，所以我没法用课程中提供的script/domain_xulie.pl提取保守结构域序列，请问有其他的方法或者脚本吗？谢谢 下面是利用hmmsearch搜索的结果文件进行提取保守结构...
...人都需要用到PubMed，功能非常强大，绝大多数的文献都能搜索得到，但是pubmed的高级功能可能很多人还不知道->那就是自定义筛选条件：最好的应用就是将文献按照影响因子进行分类，如下图所示： 做到这个只需简单三...
...陆之后就可以去下载参考基因组，输入自己物种的拉丁名搜索，之后点击添加到genome selected： 点击物种名称，进入物种介绍页面： 基因组介绍页面，可点击download页面下载： 勾选自己想要的数据，最后到购物车中下载即可...
...nlm.nih.gov/geo/。 GEO数据库dataset和profiles区别 我们在NCBI上搜索数据的时候，会发现有两个搜索入口，GEO DataSets 和 GEO Profiles，那么他们有什么不同呢： 通过下面的介绍，我们就可以知道他们的不同了： 搜索数据选择GEO DataSets，...
...的下一行读给 next_linenext_line = old_file.readline()# 连续覆盖剩余行，后面所有行上移一行while next_line: new_file.write(next_line) next_line = old_file.readline() new_file.truncate() 相关链接：https://blog.csdn.net/qq_31135027/article/detail...