Kaplan-Meier法是现如今生信分析最常用的方法之一，先通过计算出活过一定时期的患者再活过下一时期的概率（即生存概率），然后将逐个生存概率相乘，得到相应时段的生存率。基于这一方法，绘制出KM生存曲线能够直观展现分...
我要做Gwas分析，需要生成hapmap文件，但是我直接用vcf转hapmap会报错Please first use SortGenotypeFilePlugin to correctly order the file.所以我就用tassel去排序然后可以正常生成hapmap文件了，但是我的两条比较小的contig不见了
最近在分析BSA数据，然后获得区间后需要根据候选区间进行KASP标记的设计，然后向老师请教一下方法，以及或者这方面的课程
...的定点突变区域，这样既可以获得足够的序列多样性，又不会破坏蛋白质结构。对CDR进行定点突变时，可以对多个CDR进行平行突变或进行逐步优化。 ④DNA改组 DNA改组技术是对同源的抗体基因，采用脱氧核糖核酸酶Ⅰ将其切...
...！ 我因研究课题需要，要进行细菌生物信息学分析，但我不会Bio-linux系统安装及在该系统下安装其他生信分析软件，因此，来此求救，希望懂的人能帮忙指导一下,能语音指导的话最好了，我实在是一点生信背景都没有...
...到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高
...）介绍基因组大小、组装结果、注释结果、图谱、共线性分析等； 3．FTP服务器：方便下载基因组相关数据； 4．可视化Blast 服务器：方便从基因组、CDS、蛋白序列中提取关心的序列。
安老师，您好，最近准备用服务器分析微生物数据，购买了宏基因组和16s课件，在学习docker从ENA数据库下载fasq数据时遇到困难，ascp -QT -I 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasq.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR180/069/SRR18...
...一个关于三倍体的疑惑，想请教：通过送样重测序和数据分析，能解决这个问题吗？ 母本发生自然突变，得到2n配子，与父本正常配子n杂交，得到三倍体子代3n。 2n配子形成方式，主要有两者类型，FDR和SDR： 第一次减数分裂...
...这两部分，我们就可以对不同物种的氨基酸序列进行注释分析。如果要对蛋白在pathway上进行可视化标注，那就需要下载pathway想的注释文件。主要有3类： 1. KGML 文件： 这个文件是对pathway 进行定义的文件，修改该文件就可以对...
...实际应用中，宽型数据更具可读性，长型数据则更适合做分析。因此，知道如何在它们之间进行转换非常有用。 reshape2包中两个主要的函数是： melt——将宽型数据融合成长型数据cast——将长型数据转成宽型数据 melt 接下来...
...表达是有显著差异的，但是仍旧有5%的概率，这个基因并不是差异基因。 单多次检验： 当两个（组）样本中有10000个基因采用同样的检验方式进行统计检验时，这个时候就有一个问题，单次犯错的概率为0.05， 进行10000次检验的...
...，通过该注释，我们就可以多不同物种的基因进行pathway 分析。
在进行双亲和混池四个样本的比对分析后，转换成排好序的bam文件，然后利用GATK进行标记重复reads时出现如下情况，没有生成标记后的bam文件，求指教
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