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文章 Python 操作 读取 写出 Excel 文件 提高工作效率

... # 0. empty(空的),1 string(text), 2 number, 3 date, 4 boolean, 5 error, 6 blank(空白表格) table.row(rowx)[0].ctype # 获取rowx行第一个单元格的值 table.row(rowx)[0].value # 返回由rowx行中所有的单元格对象组成的列表 table.row_slice(self, rowx, start_col...

问题 泛基因家族mkdir文件夹显示已存在,但目录里没有任何内容

新打开服务器只进行了修改密码的操作,但无法mkdir pan-gene-family的文件夹显示文件已存在,但目录下没有需要解压的demo文件,文件都已从网盘下了,知道是什么原因导致的,希望老师看见可以回答一下

问题 2019年最新中科院期刊分区+影响因子汇总表-生命科学类,盼分享

亲爱的作者,您好!2019年最新中科院期刊分区+影响因子汇总表-生命科学类,可否分享一下您的EXCEL,上传的图片看清楚,您总结的很到位,急盼分享,谢谢!

问题 vegan包问题请教

...师您好,我根据您提供的物种累积曲线的代码输入后绘制出结果,以下是我的输出结果而没有得到图: require(vegan) > otu <- read.table("C:/Users/CHEN/Desktop/otu_table.txt", header = T, +                   sep = "\t",row.names=1) > all &l...

问题 vegan包问题请教

...您好,请问按照vegan包绘制物种累积曲线的时候,最后得到图的结果,而得出以下内容: require(vegan)> otu <- read.table("C:/Users/CHEN/Desktop/otu_table.txt", header = T,+                   sep = "\t",row.names=1)> all <- specaccum(otu, method...

文章 excel批量去除单元格中的换行符

有人使用Excel时会小心在单元格最后加个换行符,如果比较少,可以直接删掉,但是如果较多,一个个删就会很费劲。 这里有一种快速解决的方法。 1、选择要替换的单元格区域2、按CTRL+H快捷键,弹出查找与替换对话框3、...

问题 同一个直系同源簇的Ka/Ks怎么算

...的时候直接用mafft比对CDS序列 然后用KaKs_calculator2.0算的 知道算的对对,因为我看正确的做法应该是用氨基酸序列比对 然后再转换为CDS序列 但是我用ParaAT这个软件的话因为物种太多导致文件名太长报错 运行了)

文章 MNP标记设计

...寻找SSR,去掉含有SSR的窗口。选择DP≥0.2、SNP数量大于3和包含相邻SNP的窗口。使用primer3将以上窗口设计引物。

文章 绘制PCA图时,如何删除图例中图形符号下的字母?

...的图例中,图形符号下面会有字母,如下图左;如果图中显示样本名,那么图例符号下面就会有字母,如下图右; 解决方法: 在调用fiz_pca_ind()中添加参数show.legend=FALSE fviz_pca_ind(dat.pca,ind="point",habillage=grouplist,show.legend=FA...

文章 dQTL.seq方法研究基因定位

...如果超过10,默认为10。 2. 数据文件准备 01. 通过数据分析获得混池的snp位点信息all_sample_snp.vcf。 对all_sample_snp.vcf中的snp位点进行过滤,过滤掉亲本杂合以及亲本相同的位点。 02. 格式转换 /share/work/biosoft/GATK/latest/gatk Variants...

问题 请问,利用Linux制作circos配置文件时,result文件无数据是什么原因

配置circos作图文件时,result文件夹能正常生成,也没有报错,但是result文件中,genome.blocklink.txt文件为空,genome.blocklink.txt文件只有aliment但是无数据,检查基因序号对应无误,知道问题出在哪里

文章 使用python绘制卡方分布函数(一)

...的伽马分布,堪称统计学中应用最广泛的概率分布,很多需要统计学的行业应该也听说过大名鼎鼎的西格玛分布,也是他的别称。他的泛用毋庸置疑,可非数学出生的计算这个还是颇为麻烦,因此我们用简单的python语言来实现...

问题 关于保守结构域选择几个的问题

...了,但保守结构域的图很割裂,能明显看到上面和下面的一样,写上面的基因包含了这两个结构域,下面的基因只有后面的一个结构域,这种情况应该选择两个pfam号的基因取交集还是并集呢?

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE131907)

...int header > out    seen[out]=1  }  print >> out}' 数据分析: 样本准备mata文件:meta.tsv SamplePatient_idTissueHistologySmokingPathologyEGFR_MUTEGFR_TypeStagesStages_StatusLUNG_N01P0001nLungADCNeverMDWTWTIALowLUNG_N06P0006nLungADCExMDNANAIALowLUNG_N08P0008nLungADCNe...

问题 转录组的差异基因的注释

...您好!打扰了,我做了一个有参转录组,但是有几个问题太明白,想请教您。 1.公司给的测序数据,用得到的差异基因的核苷酸序列去NCBI上找,找到对应的基因,是因为有可能选择的基因组没有上传到NCBI吗?如果这样的基...