相关系数用一种量化的方式评价两个或者多个随机变量之间的关系。这里总结三种相关系数的计算方式。 Pearson 用来衡量变量X和Y之间的线性关系。它的全称叫做Pearson product-moment correlation coefficient(好长~),简称PPMCC或者PCC。它...
...、基因结构与motif结合的图片。值得期待的是TBtools的更新比较快,很多设置都在优化中,大家可以自己去试试哦。 好了就是这些。
ggtree是R语言中一个强大的系统发育树可视化及注释软件包,可以读取多种格式(包括newick,nexus,NHX,jplace和phylip)的系统发育树文件并进行绘图。 当使用ggtree绘图出现lable显示不全的情况: p=ggtree(tree, ladderize=FALSE, size=0.3, bra...
...,如全加上txt后缀, ls | xargs -t -i mv {} {}.txt 这里通过调整ls参数可以选择文件范围,调整第二个{}可以选择编辑不同的内容 弄个进阶的,比如想删掉当前目录下所有的文件夹第一个‘_’后的内容,先随便生成一点无意义文件 ...
...从海量数据里层层筛选的! 1. 首先针对测序数据结果,比较不同时期内,不同表达丰度基因的分布情况;并结合小麦基因组的ABD异源多倍体特点,分别统计基因在基因组(ABD)上分布,以及在不同时期的表达相关性,如下图: ...
... 命令行格式:gffread gff文件 -T -o gtf文件,这里比较容易出错的就是大写T,小写o!
...。可以处理时间到事件数据,广泛应用于临床研究。逻辑回归模型(Logistic Regression)用于二分类问题,如疾病有无、治疗反应良好与否等。输出概率预测,易于解释。 这些模型基于统计理论,通常具有很好的解释性,适用于假...
...资源分散,公司(或团队)很难形成合力,团队看起来就比较松散。 其次,公司(或团队)层面的目标明确了,但是到了执行层面就会问题百出,无论是团队成员分工不均还是工作推进过程中各部门员工之间的冲突亦或是团...
...选0或1>20%的对为候选DEirlncRNA对候选DEirlncRNA对做单因素回归分析以及修正的lasso回归(10倍交叉验证,随着随机刺激因素的1000次循环),筛选出现次数>100的DEirlncRNA对获得的DEirlncRNA对做多因素cox回归从而得到风险模型计算每...
...量变量间的相关程度。变量之间相关程度的量化使用相关系数r,常见的相关系数有Pearson相关系数、Spearman相关系数以及Kendall相关系数。相关性散点图可以更直观清晰地展现相关性分析的结果,常用于生信分析中。 例如:在一...
...el单元格内回车换行 如果某个单元格力需要输入的文字比较多,该如何换行呢?具体操作有两种。 一是“Alt+Enter”进行换行,二是点击“开始-自动换行”。 以上即是小编整理的几个excel表使用的小技巧。其实,大家在使用...
...基础正在快速变化,那么在不断迭代项目的同时,敏捷中如何定义完成?我们如何知道已经真正完成了任务?这是一个有趣的问题。在回答这个问题之前,让我们先了解关于敏捷及其方法论。一、在敏捷中如何完成工作简单来说...
venn图是转录组结果中的重要展示部分,能够找出各比较组之间共有和特有的基因,是最常用的转录组分析手段之一。但往往测序公司只给了几个固定组合的venn图,后期让公司补图,要加钱不说,两天给一副图的速度更是要命。 ...