也就是ALT列为.的行 我想用vcftools或者bcftools的命令没找到官方命令 自己写命令删除ALT列为.的行它正常运行但是生成的文件没办法正常打开,显示binary文件求大佬解答
本地镜像导入:系统运行时
...细胞内建的防御机制之一,在生物的正常发育及疾病抵御中起到重要的作用。 凋亡是个复杂的过程,至少有两种主要途径 – 内在和外在 – 导致了程序性细胞死亡。目前至少有十数种检测细胞凋亡的方法,从大框架上讲,可...
...${query}.fa rm sv.${query}.svmu_CNV.vcf echo -e "#CHROM\tPOS\tID\tREF\tALT\tQUAL\tFILTER\tINFO\tFORMAT\t${query}" >>sv.${query}.svmu_CNV.vcf cat sv.${query}.svmu_CNV.xls | while read n do chr=`echo $n | awk '{print $1}'` pos=`echo $n | awk ...
告诉你一个秘密: 距离2020年研究生考试只剩26天了。。。 而你还在刷手机。。。 据数据推测,2020考研将难到吓人! 2019年考研人数是290万,增幅21.8%, 根据这一数据,有网友推断2020年考研人数将增至340万,比2019年多50万人...
命令: /public/software/singularity/bin/singularity exec /public/home/huangyou/docker-images/reseq-v2.0.sif gatk --java-options HaplotypeCaller -R /public/home/wangyongsheng/PepsiCo_OT3098_V2_panoat_nomenclature.fasta \ -I /public/home/wangyongsheng/oats/text/picard-bam/${i}.sorted.dedup.bam \...
部分Rstudio快捷键 Ctrl - o 打开文件 Ctrl - Shift - C 取消注释或注释当前选定区域 Ctrl - f 查找搜索 Ctrl - d 删除行 Ctrl - s 保存 Ctrl - z 撤销 Ctrl - 1 将光标定位到代码编辑器 Ctrl - 2 将光标定位到控制台 Ctrl - 3 将焦点定位到帮助...
想请教一下老师,mega软件导出来的network文件,用figtree打开为啥是小数?figtree中如何只显示大于70%的bootstrap值?
...目的人都会遇到VCF文件,这个文件记录了所有样品基因组中所有位置变异(主要包括SNP和InDel)信息。后续几乎所有的分析内容都是基于此文件,比如进化树分析、群体结构分析、PCA分析、GWAS关联分析等等。因此了解VCF文件格式...
老师您好,公司帮我整理的last.gene.pair文件中pangenID为啥用品系的缩写命名呢,没有规律性。这个不影响后续的分析吗?
...用法上有所区别: 区分方法: rename --version 如果返回结果中包含 util-linux , 说明是 C 语言版本, 反之是 Perl 版本 区别: C语言版本, 支持通配符[常用通配符说明]? 表示一个任意字符* 表示一个或一串任意字符[charset] 可替代...
老师您好,在进行mcscanX共线性分析时,提取不了对应的蛋白序列,基因id和蛋白id好像没有对应关系,,,这是已提取的AT.gff文件转录本名称都是下面这样的。。。新人刚接触这个,麻烦老师了!可以通过修改get_fa_by_id.pl的脚本...