基因家族分析中mcscanX共线性分析时,提取不了对应的蛋白序列

老师您好,在进行mcscanX共线性分析时,提取不了对应的蛋白序列,基因id和蛋白id好像没有对应关系,,,这是已提取的AT.gff文件attachments-2020-07-amk12RFL5f21892959168.pngattachments-2020-07-nNgK7y6g5f21892c57cb7.png转录本名称都是下面这样的。。。attachments-2020-07-PgBmoB3y5f218ab7ec5bc.png新人刚接触这个,麻烦老师了!可以通过修改get_fa_by_id.pl的脚本解决吗?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

提取不了可以看看课程的最后一节有解决办法,你去看看:

attachments-2020-07-SZRrkk6L5f2390a74ad09.png

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  • icellar 提出于 2020-07-29 22:43

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