问题 基因表达量可以查询吗

请问基因在某个物种，某个部位的表达量可以不通过做荧光定量，而是在网站上搜索得到吗？

问题 GWAS表型如何表示

请教，做GWAS关联颜色性状，应该怎么表示这个颜色才好，其他的性状都是量化具体的数值，颜色这个不知道该怎么表示才好

问题 老师，您好！在进行不同物种之间的共线性分析时，当执行#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件： /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype --format=pdf --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout这个命令时出现了错误，绘制的共线性图也不对，这是怎么回事呢

问题 荧光定量验证转录组结果该怎么看？

你好，我想请教您，我做荧光定量验证转录组的结果，分析荧光定量数据的时候发现转录组中说明差异基因上下调情况基本一致，但我做差异显著性分析时，发现试验组和对照组的基因都没差异，这种情况转录组结果是准确的吗...

问题 基因家族一个基因的两个结构域序列重叠

我做的酶基因家族都具有两个结构域，但是分析完之后有一个基因这两个结构域相互重叠了（其他成员都是正常的，两个结构域彼此离得很远没有重叠），还可以把这个基因作为基因家族成员继续分析吗

问题 重复序列注释geneID这一步

...0 *** ======= Backtrace: ========= /usr/lib64/libc.so.6(+0x82b36)[0x73e8f52b2b36] /usr/lib64/libc.so.6(__libc_calloc+0xb4)[0x73e8f52b6214] geneid[0x40b459] geneid[0x40ed29] geneid[0x401aa5] /usr/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5)[0x73e8f5252555] geneid[0x401f8d] 请问药怎么解决...

文章 【深圳敏捷狂欢大会】腾讯P4/华为高级产品管理专家敏捷开发实战分享

...8日（星期日） 地址：（广东深圳）南山区软件产业基地5栋C座2层创展谷 报名链接：https://www.huodongxing.com/event/6506128760000 限时免费！想要参加的朋友尽快报名啦！

问题 老师您好，我按照课程提供的流程泡自己的数据，在fst pi tajimaD分析的过程中，发现生成的曼哈顿图没有数据，在第一步的过程中，我们确实成功的生成了染色体对应的起始位置和pi值，但在pi多样性绘图输出时却发现没有数据，这是怎么回事呢，请老师帮忙解决

第一步pi多样性生成的数据（pi.wild.windowed.pi） 第二步：pi多样性绘图输出时，pi_manhattan_plot.r -i pi.wild.windowed.pi -F $FAI -f 42350435 -n pi.JR.wild，我是根据自己的参考基因组中染色体的最小值来进行筛选的最小值：42350435。 但是这...

文章 MUMmer + SVMU : CNVs

...n1 C24 Cvi Eri Kyo Ler Sha;do  grep CNV sv.${query}.txt | awk '$(NF-2)>50' | awk '$NF!=0&&$(NF-1)!=0&&$NF!="inf"&&$(NF-1)!="inf"' | awk '$NF/$(NF-1)>=2||$(NF-1)/$NF>=2' > sv.${query}.svmu_CNV.xls  samtools faidx ${query}.fa  rm sv.${query}.svmu_CNV.vcf  echo -...

问题 多序列比对构树

请问一下，多序列比对之后的结果可以直接用于构树，不进行gap删除吗？因为我的序列比较多（几百条），用gblocks提取的保守序列很短，不到10bp，太短了构不了树。

问题 有参转录组比对

进行有参比对时，输入文件不为空，但是比对后的sam文件为空，这是啥原因。另外测序为单端测序，是否链式未知（公共数据库）。

问题 老师好，我想问一下，RSEM、FPKM和TPM是一个什么样的关系呢？reads count又有怎样的用途，与前面三个有关系吗？有一篇paper中说，The RNA-Seq by Expectation–Maximization (RSEM) expression values were used for statistical analysis.这是说统计学分析需要用RSEM标准化处理后才能进行吗？

问题 RSEM定量的问题

老师您好！ 学生在视基因表达水平分析的学习中，对RSEM定量中的TPM和FPKM不大懂，特来请教各位老师： 以上图为例，请问老师： ①TPM和FPKM值有些等于0、有些等于1.65，1.74，请问老师代表什么意思，是表达量的意思吗？ ②假...

文章 TCGA数据中如何区分样本是癌症还是癌旁

...A数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》《TCGA-基因差异表达分析》《TCGA-转录因子调控》《TCGA-ceRNA调控网络分析》

文章 华科研究生跳楼自杀！导师的压榨有多可怕？

...文如下：大致意思是这样的：陈同学的导师徐某平时基本不管他的学业，并且让他到某公司去上班，一个月只有300元，相当于让他免费做苦力，自然而然，他的学业也受到影响。然后，在毕业季的时候，导师怕影响自己的招生名...