5 多序列比对构树

请问一下,多序列比对之后的结果可以直接用于构树,不进行gap删除吗?因为我的序列比较多(几百条),用gblocks提取的保守序列很短,不到10bp,太短了构不了树。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果序列相似性高,是可以直接构建进化树的。

但是,有时候序列差异到,无法构建进化树,所以需要手动或者借助软件删除一些差异大的区域,保留保守的区域构建进化树。

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  • 提出于 2019-12-30 15:44

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