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文章 perl 中批量创建不同的文件,用于文件批量分隔成文件

#分享一段代码 use FileHandle;use PerlIO::gzip;if ($ARGV[4]=~/gz$/){open IN, "<:gzip", "$ARGV[0]" or die "$!  actions";}else{open IN, "$ARGV[0]" or die "$!";} #批量创建文件,把创建的文件句柄放到,hash中存储; my%fout=();for my$i (1..10){my $f=FileHandle->new("&g...

文章 beta多样性中的距离矩阵总结

Beta 多样性不同生态系统之间多样性比较:物种丰富度(有无)和均匀度(相对丰度) 先看纵向: present/absence: 基于物种丰富度(种类有无)的计算距离矩阵,样品中稀有OTU数量对其影响较大,稀有OTU也就是相对丰度很低...

问题 如果interproscan数据库只指定部分,对注释结果影响大吗?

请教老师,-appl CDD,COILS,Gene3D,Pfam,SMART(运行ok,约4时),是否还需要增加哪些必须的数据库?谢谢

文章 如何将SNP标记转化成可跑胶验证的CAPS标记

...且对DNA的浓度要求不严格;使用的引物较长,扩增的结果比较稳定且避免了RFLP分析中的膜转印这一步骤,又能保持RFLP分析的精确度。另外,由于很多限制性内切酶均可与扩增DNA酶切,所以检测到多态性机会较大。操作简便、快...

文章 快速高效KM生存曲线绘制-脚本使用

...浸润组的生存率更高。同时图中还添加了基于Log-rank检验比较两组生存曲线得到的P值,通过P值可以判断两组生存曲线之间是否有统计学差异,一般认为P值于0.05即表示两组间有显著的生存差异。 为了使大家更简便快捷地绘...

文章 corrplot包绘制相关性图,简单又好看!

... tl.col = "black", addCoef.col = "black", # 添加相关系数 number.cex = 0.7) # 数字字体大 结果如下图: 图形类型默认为圆形,将其改为矩形的: corrplot(corr_matrix,method = 'square', type = "upper", order = "AO...

文章 如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

...的文章,搜索结果是50437篇文章。如此多的文章,我们该如何找到我们想要的呢? 即使我们按照年份进行筛选,比如只看2018年发表的文章,也有3032篇。 通常我们不是特别在意文章具体是哪一年发的,而是更关心这文章发...

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

文章 细胞转染效率低怎么破?攻略在这里......

...中,大部分的工作是利用基因功能研究来探索生命过程,如何将目的基因导入细胞内是科学实验过程中不可缺少的实验技术,而细胞转染是完成这一过程的必需步骤。 在实验当中,我们经常遇到的一种情况就是转染完细胞,...

文章 muscle新版,旧版使用的一些差别

...马尔可夫模型(HMM)的参数,muscle利用的ppp算法是随机量调整其隐马尔可夫模型(HMM)的参数。这些调整称为扰动。 HMM 参数是 0 到 1 范围内的概率。按照惯例,SEED=0表示没有引入扰动,因此 使用默认的 HMM 概率。 5.其他参数...

文章 研究miRNA必备的分析网站汇总!

...酸的RNA分子,可通过多种途径调控基因的表达。目前研究比较清楚的3条调控途径分别是:DNA甲基化,RNA剪切和翻译阻止。在调控基因表达、细胞周期、生物体发育时序,疾病等方面都起到重要作用。 miRBase miRBase数据库是一个...

文章 CORNERSTONE,一款让你无法自拔的项目管理工具

...间间隔)所需要的工时、成本等信息,从而可以更合理地调整资源在任务上的分配。 新建任务: 为了方便各位成员,分配任务,现在再也不用操作那么多的繁琐步骤,点击需要分发任务的项目组成员任意空白位置,拖拽...

文章 科研人员必备-护眼神器CareUEyes

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文章 腾讯敏捷之道,实施敏捷开发,看我就够了

...才能憋出一个来 , 那还不被打的满地找牙?   问题是如何才能反应迅速?  我们先来看一个场景:   一、残酷的现实 软件开发有一大难题就是客户脑子中的需求难于描述出来, 我们通常的应对方法是这样: 先花上几个...

文章 BaiduPCS-Go 使用技巧

BaiduPCS-Go是用Go语言写的一个开源的工具,可以以较快的速度完成网盘与文件之间的上传/下载,今天来分享一些好用的功能。 使用教程见:百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go用法 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com) 1. 分享...